RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	ENT1	Q12518	454 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SMC3	P47037	1230 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	GRX6	Q12438	231 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	KCC4	P25389	1037 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	IME2	P32581	645 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SAS4	Q04003	481 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	MSB4	Q12317	492 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	IES2	P40154	320 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	CRF1	Q04930	467 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	YKR018C	P36114	725 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	ATG2	P53855	1592 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	DSN1	P40568	576 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	GYP7	P48365	746 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SPO1	P53541	631 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	VPS64	Q03944	604 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	MSP1	P28737	362 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	PES4	P39684	611 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	RCM1	P53972	490 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	RNT1	Q02555	471 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SNT2	P53127	1403 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	GTT3	P39996	337 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	BBC1	P47068	1157 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	POL32	P47110	350 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	PEP1	P32319	1579 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	CYC8	P14922	966 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	XKS1	P42826	600 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	BTN2	P53286	410 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	AAD16	Q02895	342 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SRC1	Q03707	834 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	CSE1	P33307	960 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	TTI1	P36097	1038 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	DID4	P36108	232 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	RSC30	P38781	883 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	PBY1	P38254	753 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	PDR18	P53756	1333 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	BUD6	P41697	788 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RRP5	YMR229C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	GAL2	P13181	574 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SIP3	P38717	1229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	PSH1	Q12161	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RTC1	Q08281	1341 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SWI6	P09959	803 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	TAF13	P11747	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SAP190	P36123	1033 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SPT8	P38915	602 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
RRP5	YMR229C	PDR11	P40550	1411 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SQT1	P35184	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	ALG2	P43636	503 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RBA50	Q04418	439 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	NKP2	Q06162	153 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SAS3	P34218	831 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RGD1	P38339	666 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SDH5	Q08230	162 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	PET123	P17558	318 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	CDC11	P32458	415 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	DLD1	P32891	587 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	VPS20	Q04272	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	MSM1	P22438	575 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	FET4	P40988	552 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	ENV9	Q08651	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	BDF1	P35817	686 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	TRK1	P12685	1235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	MSH3	P25336	1018 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	SGM1	P47166	707 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	MSN5	P52918	1224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	CTR9	P89105	1077 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RRP5	YMR229C	RRM3	P38766	723 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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