RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	RAD59	Q12223	238 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	RTT106	P40161	455 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	YBL086C	P38177	466 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	FIG4	P42837	879 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	ITT1	Q04638	464 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	OPT2	Q06593	877 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	NUP85	P46673	744 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	APP1	P53933	587 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	YPR084W	Q06821	456 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	SRF1	Q12516	437 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPT21	YMR179W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	ACO2	P39533	789 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	AAD14	P42884	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	TEC1	P18412	486 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	YLR346C	Q06139	101 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	ARG82	P07250	355 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	CAF120	P53836	1060 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	MIP1	P15801	1254 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	MKS1	P34072	584 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	YJR098C	P47139	656 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	SCW11	P53189	542 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	LSC2	P53312	427 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	DLD1	P32891	587 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	HPC2	Q01448	625 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	FBP26	P32604	452 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	YIR007W	P40566	764 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	DFG5	Q05031	458 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	FRA1	Q07825	749 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPT21	YMR179W	STE6	P12866	1290 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	GUT2	P32191	649 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	CSE4	P36012	229 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	UBP2	Q01476	1272 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	BDS1	Q08347	646 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	APL6	P46682	809 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	ATG20	Q07528	640 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	OSH7	P38755	437 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	ISU1	Q03020	165 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	TFB3	Q03290	321 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	HPF1	Q05164	967 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	MCM16	Q12262	181 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	CCP1	P00431	361 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	PKC1	P24583	1151 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	YBL036C	P38197	257 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	ROG3	P43602	733 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	MRX12	P47084	519 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	BRL1	P38770	471 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	EMP47	P43555	445 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	VTC4	P47075	721 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	TRK2	P28584	889 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	ISF1	P32488	338 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	YGR035C	P53222	116 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SPT21	YMR179W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	BIO2	P32451	375 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	DAL1	P32375	460 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	WTM2	Q12206	467 aa		3.62	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	SLA1	P32790	1244 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	SSN3	P39073	555 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	DPH6	Q12429	685 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	UTR2	P32623	467 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	YPP1	P46951	817 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	MSN5	P52918	1224 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	YNL108C	P53929	270 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	LYS5	P50113	272 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	JJJ3	P47138	172 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	RIM21	P48565	533 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SPT21	YMR179W	SOH1	P38633	127 aa		3.59	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	CUZ1	P53899	274 aa		3.59	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	SLX8	P40072	274 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	ATG3	P40344	310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	UBP15	P50101	1230 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	HDA3	Q06623	655 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	YPR204W	Q08995	1032 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	SUM1	P46676	1062 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	YJL007C	P47080	104 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	TBS1	P38114	1094 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SPT21	YMR179W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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