RNA–Protein interactions for RNA: YHR132C

ECM14, Transcript of Putative metalloprotease with similarity to zinc carboxypeptidases, yeastyeast

Gene ECM14, Length 1,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM14YHR132C SNF2P22082 1703 aa8.15□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C SPT7P35177 1332 aa8.14□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C PDI1P17967 522 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C CSE4P36012 229 aa8.13□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C AUS1Q08409 1394 aa8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C STS1P38637 319 aa8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C TAP42Q04372 366 aa8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C YJL171CP46992 396 aa8.11□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C NST1P53935 1240 aa8.11□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C RTF1P53064 558 aa8.09□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C YPR148CQ06523 435 aa8.09□□□□□ -1.11
ECM14YHR132C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C GRX4P32642 244 aa8.08□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C APP1P53933 587 aa8.08□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C ENT1Q12518 454 aa8.08□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C ULI1P43604 169 aa8.07□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C KIN1P13185 1064 aa8.06□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C RSF2P46974 1380 aa8.06□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C RAM2P29703 316 aa8.05□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C ENV9Q08651 330 aa8.05□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C IOC2Q12072 812 aa8.05□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C SLM3Q12093 417 aa8.05□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C TRK1P12685 1235 aa8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C KAR2P16474 682 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C HIM1Q06674 414 aa8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C YOL036WQ08206 761 aa8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C GAS4Q08271 471 aa8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C RIM15P43565 1770 aa8.03□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C SET4P42948 560 aa8.03□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C TCB1Q12466 1186 aa8.03□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C LDB19Q12502 818 aa8.03□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C AIM44Q99299 758 aa8.03□□□□□ -1.12
ECM14YHR132C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C MSB4Q12317 492 aa8.02□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C DSF2P38213 736 aa8.01□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C IOC4Q04213 475 aa8.01□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C PBS2P08018 668 aa8□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C ENP1P38333 483 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C SIR4P11978 1358 aa7.99□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C SAM3Q08986 587 aa7.99□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C XKS1P42826 600 aa7.98□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C IES2P40154 320 aa7.97□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C YRF1-4O13559 1382 aa7.97□□□□□ -1.13
ECM14YHR132C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C PAP2P53632 584 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C GLC3P32775 704 aa7.94□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C BMT6Q12291 365 aa7.94□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.92□□□□□ -1.14not detected
ECM14YHR132C DSD1P53095 428 aa7.92□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C AIM7Q12156 149 aa7.92□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C MAM3Q12296 706 aa7.91□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C EDE1P34216 1381 aa7.9□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C RTG1P32607 177 aa7.9□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C YKL133CP36066 463 aa7.9□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C DOT5P40553 215 aa7.9□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C YMR074CQ04773 145 aa7.9□□□□□ -1.14
ECM14YHR132C RPP0P05317 312 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C PRD1P25375 712 aa7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C CTF4Q01454 927 aa7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C MEC3Q02574 474 aa7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C YDL144CQ07589 356 aa7.89□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C HSP104P31539 908 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C MPP10P47083 593 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C ADE16P54113 591 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C YML020WQ03722 664 aa7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C INP54Q08227 384 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C GYP5Q12344 894 aa7.87□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C NUP145P49687 1317 aa7.86□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C NTH2P35172 780 aa7.86□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C PRS1P32895 427 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C VPS27P40343 622 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C THI22Q06490 572 aa7.85□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C AOS1Q06624 347 aa7.85□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C YKR075CP36155 307 aa7.84□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C GUA1P38625 525 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
ECM14YHR132C COBP00163 385 aa7.83□□□□□ -1.16
ECM14YHR132C YNL050CP53952 270 aa7.83□□□□□ -1.16
ECM14YHR132C CDC45Q08032 650 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.1 ms