RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C TRK1P12685 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C GAS4Q08271 471 aa7.55□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C MST1P07236 462 aa7.54□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C GRX4P32642 244 aa7.53□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C RTF1P53064 558 aa7.53□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C RSF2P46974 1380 aa7.53□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C TCB1Q12466 1186 aa7.52□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C LEU3P08638 886 aa7.5□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C IES2P40154 320 aa7.5□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C XKS1P42826 600 aa7.5□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C KAR2P16474 682 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C SNF2P22082 1703 aa7.48□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RRP4YHR069C DOT5P40553 215 aa7.46□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C IOC4Q04213 475 aa7.46□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C YRF1-4O13559 1382 aa7.46□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C SIR4P11978 1358 aa7.46□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C YMR074CQ04773 145 aa7.45□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.44□□□□□ -1.22not detected
RRP4YHR069C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C COQ8P27697 501 aa7.43□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C YKL133CP36066 463 aa7.42□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C DSD1P53095 428 aa7.42□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C PAP2P53632 584 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C EDS1P38073 919 aa7.41□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C RIM15P43565 1770 aa7.41□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C ENP1P38333 483 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C GTT3P39996 337 aa7.4□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C ADE16P54113 591 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRP4YHR069C YKR075CP36155 307 aa7.39□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C INP54Q08227 384 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C COBP00163 385 aa7.38□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C HSP104P31539 908 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C RPN11P43588 306 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C PRD1P25375 712 aa7.37□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C NTH2P35172 780 aa7.37□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C NUP145P49687 1317 aa7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C NPR2P39923 615 aa7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C MPP10P47083 593 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C CTF4Q01454 927 aa7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C MEC3Q02574 474 aa7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C THI22Q06490 572 aa7.36□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C OSM1P21375 501 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C YDL144CQ07589 356 aa7.35□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C WSC3Q12215 556 aa7.34□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.34□□□□□ -1.23
RRP4YHR069C EDE1P34216 1381 aa7.33□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C YNL050CP53952 270 aa7.33□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C AOS1Q06624 347 aa7.33□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C SAM3Q08986 587 aa7.33□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C RPP0P05317 312 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C PRS1P32895 427 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C UBP9P39967 754 aa7.32□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C RTT109Q07794 436 aa7.32□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C SAP155P43612 1002 aa7.31□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C ATG13Q06628 738 aa7.31□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C LAM6Q08001 693 aa7.31□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C SUI2P20459 304 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C VPS27P40343 622 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C YOL036WQ08206 761 aa7.3□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C PRP40P33203 583 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C SET4P42948 560 aa7.29□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C UBP1P25037 809 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C KCC4P25389 1037 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C TPD3P31383 635 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C VNX1P42839 908 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C YJL181WP46987 611 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C CTH1P47976 325 aa7.28□□□□□ -1.24
RRP4YHR069C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C YBP2P53169 641 aa7.27□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C YPR148CQ06523 435 aa7.27□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C GYP5Q12344 894 aa7.27□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C GRX1P25373 110 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C UGA3P26370 528 aa7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C MAM1P40065 302 aa7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C CDC45Q08032 650 aa7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C ALE1Q08548 619 aa7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C LYS2P07702 1392 aa7.25□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C COQ4O13525 335 aa7.25□□□□□ -1.25
RRP4YHR069C RRT14P40470 206 aa7.25□□□□□ -1.25
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