RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640715.1

SLC35A3-222, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-222	ENST00000640715	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SLC35A3-222	ENST00000640715	TONSL	Q96HA7	1378 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SLC35A3-222	ENST00000640715	KIF3B	O15066	747 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	A2M	P01023	1474 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.01	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.24
SLC35A3-222	ENST00000640715	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
SLC35A3-222	ENST00000640715	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.98	■■■□□ 2.23
SLC35A3-222	ENST00000640715	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SLC35A3-222	ENST00000640715	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.95	■■■□□ 2.23
SLC35A3-222	ENST00000640715	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	KANK1	Q14678	1352 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SLC35A3-222	ENST00000640715	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	GGT6	Q6P531	493 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	TET3	O43151	1660 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SLC35A3-222	ENST00000640715		E9PCH4	1651 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SLC35A3-222	ENST00000640715	ATP10A	O60312	1499 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SLC35A3-222	ENST00000640715	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SLC35A3-222	ENST00000640715	CEP152	O94986	1710 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SLC35A3-222	ENST00000640715	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SLC35A3-222	ENST00000640715	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SLC35A3-222	ENST00000640715	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SLC35A3-222	ENST00000640715	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	PTPRT	O14522	1441 aa		28.7	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.69	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCC3	O15438	1527 aa		28.68	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	TRPM2	O94759	1503 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.65	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	AGL	P35573	1532 aa		28.64	■■■□□ 2.18
SLC35A3-222	ENST00000640715	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	NPAT	Q14207	1427 aa		28.62	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.6	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	MLEC	Q14165	292 aa		28.56	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.54	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.49	■■■□□ 2.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	NOS1	P29475	1434 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.46	■■■□□ 2.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	KIF1B	O60333	1816 aa		28.45	■■■□□ 2.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.42	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		28.4	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	SYNM	O15061	1565 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.35	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	IDI1	Q13907	227 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.33	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
SLC35A3-222	ENST00000640715	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.33	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	USP47	Q96K76	1375 aa		28.3	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.27	■■■□□ 2.12
SLC35A3-222	ENST00000640715	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	MYOM2	P54296	1465 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	PPL	O60437	1756 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SLC35A3-222	ENST00000640715	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SLC35A3-222	ENST00000640715	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1

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