RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637507.1

CAPN15-208, Transcript of calpain 15, human

TSL 5

Gene CAPN15, Length 1,482 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPN15-208	ENST00000637507	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CAPN15-208	ENST00000637507	ITGAE	P38570	1179 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CAPN15-208	ENST00000637507	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CAPN15-208	ENST00000637507	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CAPN15-208	ENST00000637507	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CAPN15-208	ENST00000637507	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
CAPN15-208	ENST00000637507	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CAPN15-208	ENST00000637507	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	C3	P01024	1663 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	NPAT	Q14207	1427 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.41	■■■□□ 2.94
CAPN15-208	ENST00000637507	KANK1	Q14678	1352 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	ABCC3	O15438	1527 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CAPN15-208	ENST00000637507	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	PZP	P20742	1482 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	HSPA2	P54652	639 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CAPN15-208	ENST00000637507	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CAPN15-208	ENST00000637507	TNR	Q92752	1358 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPN15-208	ENST00000637507	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CAPN15-208	ENST00000637507	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	NAIP	Q13075	1403 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	CEP152	O94986	1710 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	NUP155	O75694	1391 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CAPN15-208	ENST00000637507	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CAPN15-208	ENST00000637507	UNC13B	O14795	1591 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CAPN15-208	ENST00000637507	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CAPN15-208	ENST00000637507	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CAPN15-208	ENST00000637507	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CAPN15-208	ENST00000637507	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.01	■■■□□ 2.88
CAPN15-208	ENST00000637507	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	TET3	O43151	1660 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	NOS1	P29475	1434 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPN15-208	ENST00000637507	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	PKD2	Q13563	968 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	IDI1	Q13907	227 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CAPN15-208	ENST00000637507	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CAPN15-208	ENST00000637507	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CAPN15-208	ENST00000637507	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
CAPN15-208	ENST00000637507	PTPRT	O14522	1441 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CAPN15-208	ENST00000637507	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPN15-208	ENST00000637507	SYNM	O15061	1565 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPN15-208	ENST00000637507		E9PCH4	1651 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CAPN15-208	ENST00000637507	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPN15-208	ENST00000637507	HRC	P23327	699 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPN15-208	ENST00000637507	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	SLIT1	O75093	1534 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	LTK	P29376	864 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	MED14	O60244	1454 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
CAPN15-208	ENST00000637507	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	FOXD1	Q16676	465 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	TRPM2	O94759	1503 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPN15-208	ENST00000637507	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CAPN15-208	ENST00000637507	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CAPN15-208	ENST00000637507	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
CAPN15-208	ENST00000637507	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8

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