RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC5-204ENST00000596148 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.39■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 PLCB2Q00722 1185 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 APBB1O00213 710 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 PANK3Q9H999 370 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 GORABQ5T7V8 394 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 USP47Q96K76 1375 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 NGEFQ8N5V2 710 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 GBP4Q96PP9 640 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.33■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRDM2Q13029 1718 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 KIF21BO75037 1637 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 CFTRP13569 1480 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 IFT140Q96RY7 1462 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 E9PSI1 815 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 SYNJ2O15056 1496 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.26■■□□□ 1.64
TRAPPC5-204ENST00000596148 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 MIA2Q96PC5 1412 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 NUTM2FA1L443 756 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 HMGXB3Q12766 1538 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 NCOA2Q15596 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 TEFQ10587 303 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 EVA1CP58658 441 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 G3V3G9 751 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 DRC7Q8IY82 874 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC5-204ENST00000596148 KIF3AQ9Y496 699 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 TPM4P67936 248 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 PSME1Q06323 249 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 ST18O60284 1047 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 ROCK1Q13464 1354 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 CLSTN1O94985 981 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 TOP2BQ02880 1626 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 TOPBP1Q92547 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 HFM1A2PYH4 1435 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 RUNDC1Q96C34 613 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 HECW1Q76N89 1606 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 KIF16BQ96L93 1317 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 SYNJ1O43426 1573 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC5-204ENST00000596148 CCDC7Q96M83 1385 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC5-204ENST00000596148 ATF3P18847 181 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC5-204ENST00000596148 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC5-204ENST00000596148 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms