RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP13Q86W25 1043 aa10.31□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 STAC3Q96MF2 364 aa10.31□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 UNC13BO14795 1591 aa10.31□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC24A1O60721 1099 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 PLXNC1O60486 1568 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP10AO60312 1499 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 PREX2Q70Z35 1606 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY4P0CV99 314 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY10P0CW01 314 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 PKD2Q13563 968 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP155O75694 1391 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC184Q52MB2 194 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 NGEFQ8N5V2 710 aa10.26□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 DEKP35659 375 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC6Q03468 1493 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 CDCA8Q53HL2 280 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ERBINQ96RT1 1412 aa10.21□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.21□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP10BO94823 1461 aa10.2□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.2□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SYNMO15061 1565 aa10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.19□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 AAMPQ13685 434 aa10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 TMF1P82094 1093 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 BACH2Q9BYV9 841 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.17□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYM3Q14202 1370 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 JPH4Q96JJ6 628 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3C2GO75747 1445 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 IQGAP1P46940 1657 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC2Q92887 1545 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE4AP27815 886 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 A2MP01023 1474 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 SHROOM2Q13796 1616 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 ADRA2BP18089 450 aa10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP152O94986 1710 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 TRPM2O94759 1503 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 MADDQ8WXG6 1647 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 DEPDC5O75140 1603 aa10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CAPNS1-202ENST00000586851 NBR1Q14596 966 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms