RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577700.5

SNHG15-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 15, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG15, Length 3,116 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG15-202ENST00000577700 KDM5CP41229 1560 aa20.39■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 ERBB4Q15303 1308 aa20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 PRDM2Q13029 1718 aa20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 ESPNB1AK53 854 aa20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 NLRP13Q86W25 1043 aa20.38■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 WDR62O43379 1518 aa20.37■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 SEC24BO95487 1268 aa20.37■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.36■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.36■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.36■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 TPM2P07951 284 aa20.34■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 MBD5Q9P267 1494 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.33■□□□□ 0.85
SNHG15-202ENST00000577700 MRE11P49959 708 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.32■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 MCM4P33991 863 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 ARHGEF11O15085 1522 aa20.3■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 KIF14Q15058 1648 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.29■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 AAMPQ13685 434 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.28■□□□□ 0.84
SNHG15-202ENST00000577700 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.27■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 GRIN2BQ13224 1484 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 TRAK2O60296 914 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.26■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 NLRP1Q9C000 1473 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.25■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 E9PCH4 1651 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.24■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 IFT140Q96RY7 1462 aa20.23■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.22■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 IGHDP01880 384 aa20.22■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.22■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 SLC24A1O60721 1099 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.21■□□□□ 0.83
SNHG15-202ENST00000577700 INSRP06213 1382 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.18■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 FGD1P98174 961 aa20.17■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.16■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 PZPP20742 1482 aa20.15■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 ROCK1Q13464 1354 aa20.15■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.15■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 RIPK4P57078 832 aa20.14■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
SNHG15-202ENST00000577700 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.14■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.13■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.13■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 DAPK1P53355 1430 aa20.13■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.13■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 SAMD9Q5K651 1589 aa20.11■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.11■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.1■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 GOLGA2Q08379 1002 aa20.1■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.1■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 OFD1O75665 1012 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 BCAR3O75815 825 aa20.08■□□□□ 0.81
SNHG15-202ENST00000577700 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ABCC5O15440 1437 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 PKD2Q13563 968 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ZNF521Q96K83 1311 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 MAP7D2Q96T17 732 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 SLFN5Q08AF3 891 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.04■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.03■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 ARID3AQ99856 593 aa20.02■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 CUL7Q14999 1698 aa20.02■□□□□ 0.8
SNHG15-202ENST00000577700 TERF1P54274 439 aa20.02■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.02■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20■□□□□ 0.79
SNHG15-202ENST00000577700 MSNP26038 577 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms