RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 DEPDC5O75140 1603 aa29.76■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.75■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.73■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 KIF3BO15066 747 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 RAPGEF3O95398 923 aa29.71■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SPNS1-212ENST00000568900 TSPOAP1O95153 1857 aa29.69■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 A2MP01023 1474 aa29.68■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 RICTORQ6R327 1708 aa29.68■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 PLA2R1Q13018 1463 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 ABCA6Q8N139 1617 aa29.66■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 KANK1Q14678 1352 aa29.65■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 E9PCH4 1651 aa29.64■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.64■■■□□ 2.34
SPNS1-212ENST00000568900 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.63■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.61■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 TET3O43151 1660 aa29.61■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 ATP10AO60312 1499 aa29.59■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 MIER1Q8N108 512 aa29.59■■■□□ 2.33
SPNS1-212ENST00000568900 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.56■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-212ENST00000568900 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.51■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 CEP152O94986 1710 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 TRPM2O94759 1503 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 RGL3Q3MIN7 710 aa29.48■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 GGT6Q6P531 493 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 PTPRTO14522 1441 aa29.47■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.46■■■□□ 2.31
SPNS1-212ENST00000568900 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-212ENST00000568900 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.42■■■□□ 2.3
SPNS1-212ENST00000568900 CLTCL1P53675 1640 aa29.41■■■□□ 2.3
SPNS1-212ENST00000568900 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.37■■■□□ 2.29
SPNS1-212ENST00000568900 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.35■■■□□ 2.29
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC3O15438 1527 aa29.35■■■□□ 2.29
SPNS1-212ENST00000568900 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.35■■■□□ 2.29
SPNS1-212ENST00000568900 USP47Q96K76 1375 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS1-212ENST00000568900 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.32■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 NPATQ14207 1427 aa29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.3■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SPNS1-212ENST00000568900 KIF1BO60333 1816 aa29.26■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 REREQ9P2R6 1566 aa29.23■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC7Q96M83 1385 aa29.22■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.21■■■□□ 2.27
SPNS1-212ENST00000568900 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 MADDQ8WXG6 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 MROH2AA6NES4 1674 aa29.18■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 AGLP35573 1532 aa29.16■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.16■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.15■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.14■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 LAMC1P11047 1609 aa29.14■■■□□ 2.26
SPNS1-212ENST00000568900 STAC3Q96MF2 364 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 NOS1P29475 1434 aa29.13■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.12■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 ADGRB3O60242 1522 aa29.12■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 ANP32CO43423 234 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 SYNMO15061 1565 aa29.1■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 IFT172Q9UG01 1749 aa29.1■■■□□ 2.25
SPNS1-212ENST00000568900 PIK3C2BO00750 1634 aa29.07■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 MYOM2P54296 1465 aa29.06■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.05■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 MLECQ14165 292 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.04■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-212ENST00000568900 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SPNS1-212ENST00000568900 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29■■■□□ 2.23
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29■■■□□ 2.23
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