RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-209ENST00000559551 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.93■□□□□ 0.94
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RABGGTA-209ENST00000559551 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.91■□□□□ 0.94
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RABGGTA-209ENST00000559551 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.87■□□□□ 0.93
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RABGGTA-209ENST00000559551 CEP152O94986 1710 aa20.83■□□□□ 0.92
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RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.8■□□□□ 0.92
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RABGGTA-209ENST00000559551 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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RABGGTA-209ENST00000559551 ATP10AO60312 1499 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.74■□□□□ 0.91
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RABGGTA-209ENST00000559551 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.72■□□□□ 0.91
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RABGGTA-209ENST00000559551 AGLP35573 1532 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 TONSLQ96HA7 1378 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC3O15438 1527 aa20.71■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 GGT6Q6P531 493 aa20.71■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 KANK1Q14678 1352 aa20.71■□□□□ 0.91
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RABGGTA-209ENST00000559551 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPRTO14522 1441 aa20.67■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 TRPM2O94759 1503 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 CLTCL1P53675 1640 aa20.64■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 NPATQ14207 1427 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.61■□□□□ 0.89
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RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 SYNMO15061 1565 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.54■□□□□ 0.88
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RABGGTA-209ENST00000559551 MROH2AA6NES4 1674 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 MLECQ14165 292 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF1BO60333 1816 aa20.53■□□□□ 0.88
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RABGGTA-209ENST00000559551 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 RGL3Q3MIN7 710 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 IFT172Q9UG01 1749 aa20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRB3O60242 1522 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 ERVK-7P63135 1459 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.41■□□□□ 0.86
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RABGGTA-209ENST00000559551 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 MADDQ8WXG6 1647 aa20.39■□□□□ 0.86
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RABGGTA-209ENST00000559551 C3P01024 1663 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-209ENST00000559551 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.28■□□□□ 0.84
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