RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.96■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.95■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.93■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 A2MP01023 1474 aa20.93■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.91■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.9■□□□□ 0.94
RABGGTA-209ENST00000559551 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.89■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 PKD2Q13563 968 aa20.88■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.931e-6■■□□□ 13.5
RABGGTA-209ENST00000559551 NEUROD1Q13562 356 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.87■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF3BO15066 747 aa20.85■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 E9PCH4 1651 aa20.83■□□□□ 0.93
RABGGTA-209ENST00000559551 CEP152O94986 1710 aa20.83■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 TET3O43151 1660 aa20.81■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.8■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 PLA2R1Q13018 1463 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 REREQ9P2R6 1566 aa20.79■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP10AO60312 1499 aa20.78■□□□□ 0.92
RABGGTA-209ENST00000559551 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.74■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.73■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 AGLP35573 1532 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 TONSLQ96HA7 1378 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC3O15438 1527 aa20.71■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 GGT6Q6P531 493 aa20.71■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 KANK1Q14678 1352 aa20.71■□□□□ 0.91
RABGGTA-209ENST00000559551 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPRTO14522 1441 aa20.67■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 TRPM2O94759 1503 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 CLTCL1P53675 1640 aa20.64■□□□□ 0.9
RABGGTA-209ENST00000559551 NPATQ14207 1427 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 SYNMO15061 1565 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 NOS1P29475 1434 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 MROH2AA6NES4 1674 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 MLECQ14165 292 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF1BO60333 1816 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-209ENST00000559551 PIK3C2BO00750 1634 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 RGL3Q3MIN7 710 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 IFT172Q9UG01 1749 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-209ENST00000559551 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRB3O60242 1522 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 ERVK-7P63135 1459 aa20.44■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 MADDQ8WXG6 1647 aa20.39■□□□□ 0.86
RABGGTA-209ENST00000559551 ZMYM3Q14202 1370 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 PPLO60437 1756 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 IDI1Q13907 227 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 C3P01024 1663 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-209ENST00000559551 MYOM2P54296 1465 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 829.5 ms