RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.1■■■□□ 2.89
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.98■■■□□ 2.23
RABGGTA-209ENST00000559551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC9O60706 1549 aa27.56■■■□□ 2
RABGGTA-209ENST00000559551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-209ENST00000559551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.28■■□□□ 1.96
RABGGTA-209ENST00000559551 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.09■■□□□ 1.93
RABGGTA-209ENST00000559551 NACADO15069 1562 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-209ENST00000559551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-209ENST00000559551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-209ENST00000559551 SCRIBQ14160 1630 aa26.63■■□□□ 1.85
RABGGTA-209ENST00000559551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.45■■□□□ 1.82
RABGGTA-209ENST00000559551 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-209ENST00000559551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.744e-10■■■□□ 15
RABGGTA-209ENST00000559551 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-209ENST00000559551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-209ENST00000559551 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-209ENST00000559551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-209ENST00000559551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-209ENST00000559551 SMARCA4P51532 1647 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-209ENST00000559551 WIZO95785 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-209ENST00000559551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.24■■□□□ 1.63
RABGGTA-209ENST00000559551 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-209ENST00000559551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-209ENST00000559551 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
RABGGTA-209ENST00000559551 SMARCA2P51531 1590 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-209ENST00000559551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-209ENST00000559551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-209ENST00000559551 NCAPD3P42695 1498 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-209ENST00000559551 HMGXB3Q12766 1538 aa24.87■■□□□ 1.57
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.83■■□□□ 1.56
RABGGTA-209ENST00000559551 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.51■■□□□ 1.51
RABGGTA-209ENST00000559551 CFTRP13569 1480 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCC8Q09428 1581 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-209ENST00000559551 PRDM2Q13029 1718 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-209ENST00000559551 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-209ENST00000559551 NESP48681 1621 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-209ENST00000559551 TRIM41Q8WV44 630 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-209ENST00000559551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-209ENST00000559551 SYNJ1O43426 1573 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-209ENST00000559551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-209ENST00000559551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.99■■□□□ 1.43
RABGGTA-209ENST00000559551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-209ENST00000559551 CUX1P39880 1505 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-209ENST00000559551 TOP2BQ02880 1626 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-209ENST00000559551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-209ENST00000559551 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-209ENST00000559551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 SOGA1O94964 1423 aa23.75■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 TOPBP1Q92547 1522 aa23.74■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.73■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RABGGTA-209ENST00000559551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-209ENST00000559551 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-209ENST00000559551 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.61■■□□□ 1.37
RABGGTA-209ENST00000559551 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-209ENST00000559551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RABGGTA-209ENST00000559551 ERCC6Q03468 1493 aa23.56■■□□□ 1.36
RABGGTA-209ENST00000559551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-209ENST00000559551 WDR62O43379 1518 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-209ENST00000559551 EEA1Q15075 1411 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-209ENST00000559551 WDR97A6NE52 1622 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-209ENST00000559551 CUX2O14529 1486 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-209ENST00000559551 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-209ENST00000559551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF27Q86VH2 1401 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-209ENST00000559551 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.39■■□□□ 1.34
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF21BO75037 1637 aa23.35■■□□□ 1.33
RABGGTA-209ENST00000559551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.34■■□□□ 1.33
RABGGTA-209ENST00000559551 IGF1RP08069 1367 aa23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-209ENST00000559551 PRXQ9BXM0 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-209ENST00000559551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RABGGTA-209ENST00000559551 IFT140Q96RY7 1462 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-209ENST00000559551 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.27■■□□□ 1.32
RABGGTA-209ENST00000559551 GOLGA3Q08378 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RABGGTA-209ENST00000559551 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
RABGGTA-209ENST00000559551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGGTA-209ENST00000559551 PBRM1Q86U86 1689 aa23.2■■□□□ 1.31
RABGGTA-209ENST00000559551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.34e-7■■■■□ 23.8
RABGGTA-209ENST00000559551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RABGGTA-209ENST00000559551 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.14■■□□□ 1.3
RABGGTA-209ENST00000559551 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.14■■□□□ 1.3
RABGGTA-209ENST00000559551 CUL7Q14999 1698 aa23.14■■□□□ 1.3
RABGGTA-209ENST00000559551 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-209ENST00000559551 GRIN2BQ13224 1484 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGGTA-209ENST00000559551 ADAMTS12P58397 1594 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-209ENST00000559551 CEP162Q5TB80 1403 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGGTA-209ENST00000559551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.97■■□□□ 1.27
RABGGTA-209ENST00000559551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-209ENST00000559551 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-209ENST00000559551 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RABGGTA-209ENST00000559551 CLIP1P30622 1438 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-209ENST00000559551 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
RABGGTA-209ENST00000559551 SYNJ2O15056 1496 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-209ENST00000559551 GRIN2AQ12879 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
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