RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
ACER3-204ENST00000525861 DEPDC5O75140 1603 aa33.23■■■□□ 2.91
ACER3-204ENST00000525861 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
ACER3-204ENST00000525861 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.21■■■□□ 2.91
ACER3-204ENST00000525861 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.21■■■□□ 2.91
ACER3-204ENST00000525861 A2MP01023 1474 aa33.13■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 RICTORQ6R327 1708 aa33.13■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.11■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 KIF3BO15066 747 aa33.1■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 RAPGEF3O95398 923 aa33.1■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 ATP10AO60312 1499 aa33.09■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 PLA2R1Q13018 1463 aa33.09■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 ABCA6Q8N139 1617 aa33.08■■■□□ 2.89
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ACER3-204ENST00000525861 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.08■■■□□ 2.89
ACER3-204ENST00000525861 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.07■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.06■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 TET3O43151 1660 aa33.04■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 TSPOAP1O95153 1857 aa33.04■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 E9PCH4 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.01■■■□□ 2.88
ACER3-204ENST00000525861 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.01■■■□□ 2.87
ACER3-204ENST00000525861 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33■■■□□ 2.87
ACER3-204ENST00000525861 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.99■■■□□ 2.87
ACER3-204ENST00000525861 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.96■■■□□ 2.87
ACER3-204ENST00000525861 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.94■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.92■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
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ACER3-204ENST00000525861 TRPM2O94759 1503 aa32.91■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.91■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.89■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.89■■■□□ 2.86
ACER3-204ENST00000525861 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.87■■■□□ 2.85
ACER3-204ENST00000525861 CEP152O94986 1710 aa32.85■■■□□ 2.85
ACER3-204ENST00000525861 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ACER3-204ENST00000525861 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.84■■■□□ 2.85
ACER3-204ENST00000525861 MIER1Q8N108 512 aa32.82■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.81■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 GGT6Q6P531 493 aa32.81■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 CLTCL1P53675 1640 aa32.78■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.78■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 RGL3Q3MIN7 710 aa32.78■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.78■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 ABCC3O15438 1527 aa32.77■■■□□ 2.84
ACER3-204ENST00000525861 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.73■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 REREQ9P2R6 1566 aa32.72■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.71■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 NPATQ14207 1427 aa32.7■■■□□ 2.83
ACER3-204ENST00000525861 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.7■■■□□ 2.82
ACER3-204ENST00000525861 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
ACER3-204ENST00000525861 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.68■■■□□ 2.82
ACER3-204ENST00000525861 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.66■■■□□ 2.82
ACER3-204ENST00000525861 USP47Q96K76 1375 aa32.65■■■□□ 2.82
ACER3-204ENST00000525861 AGLP35573 1532 aa32.63■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.63■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.62■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.61■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.61■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.61■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.6■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 KIF1BO60333 1816 aa32.6■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 STAC3Q96MF2 364 aa32.59■■■□□ 2.81
ACER3-204ENST00000525861 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.56■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 NOS1P29475 1434 aa32.55■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 MADDQ8WXG6 1647 aa32.54■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 CCDC7Q96M83 1385 aa32.53■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 LAMC1P11047 1609 aa32.53■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.53■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
ACER3-204ENST00000525861 ADGRB3O60242 1522 aa32.5■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 MROH2AA6NES4 1674 aa32.49■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.49■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 NBPF1Q3BBV0 1214 aa32.47■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 SYNMO15061 1565 aa32.46■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 PIK3C2BO00750 1634 aa32.46■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 MYOM2P54296 1465 aa32.45■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 IFT172Q9UG01 1749 aa32.45■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 KIF7Q2M1P5 1343 aa32.45■■■□□ 2.79
ACER3-204ENST00000525861 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.4■■■□□ 2.78
ACER3-204ENST00000525861 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa32.4■■■□□ 2.78
ACER3-204ENST00000525861 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
ACER3-204ENST00000525861 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.37■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 ANP32CO43423 234 aa32.36■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.34■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.34■■■□□ 2.77
ACER3-204ENST00000525861 PPLO60437 1756 aa32.32■■■□□ 2.76
ACER3-204ENST00000525861 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.32■■■□□ 2.76
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