RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 ATP10AO60312 1499 aa25.09■■□□□ 1.61
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TSNARE1-205ENST00000520166 GGT6Q6P531 493 aa25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1-205ENST00000520166 UNC13BO14795 1591 aa25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-205ENST00000520166 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-205ENST00000520166 PKD2Q13563 968 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-205ENST00000520166 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.01■■□□□ 1.59
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TSNARE1-205ENST00000520166 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-205ENST00000520166 KDM5DQ9BY66 1539 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-205ENST00000520166 DEPDC5O75140 1603 aa24.99■■□□□ 1.59
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TSNARE1-205ENST00000520166 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 REREQ9P2R6 1566 aa24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 NEUROD1Q13562 356 aa24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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TSNARE1-205ENST00000520166 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 KANK1Q14678 1352 aa24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.89■■□□□ 1.58
TSNARE1-205ENST00000520166 CEP152O94986 1710 aa24.88■■□□□ 1.57
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TSNARE1-205ENST00000520166 ABCC3O15438 1527 aa24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1-205ENST00000520166 PLA2R1Q13018 1463 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-205ENST00000520166 E9PCH4 1651 aa24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1-205ENST00000520166 TET3O43151 1660 aa24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1-205ENST00000520166 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1-205ENST00000520166 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1-205ENST00000520166 NPATQ14207 1427 aa24.77■■□□□ 1.56
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TSNARE1-205ENST00000520166 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-205ENST00000520166 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-205ENST00000520166 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1-205ENST00000520166 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 PTPRTO14522 1441 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.69■■□□□ 1.54
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TSNARE1-205ENST00000520166 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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TSNARE1-205ENST00000520166 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 ZMYM3Q14202 1370 aa24.67■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.66■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.65■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.64■■□□□ 1.54
TSNARE1-205ENST00000520166 TRPM2O94759 1503 aa24.63■■□□□ 1.53
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TSNARE1-205ENST00000520166 TONSLQ96HA7 1378 aa24.62■■□□□ 1.53
TSNARE1-205ENST00000520166 NOS1P29475 1434 aa24.61■■□□□ 1.53
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TSNARE1-205ENST00000520166 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.58■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.58■■□□□ 1.52
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TSNARE1-205ENST00000520166 IDI1Q13907 227 aa24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 ERVK-7P63135 1459 aa24.57■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.56■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.54■■□□□ 1.52
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TSNARE1-205ENST00000520166 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.52■■□□□ 1.52
TSNARE1-205ENST00000520166 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
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TSNARE1-205ENST00000520166 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1-205ENST00000520166 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.5■■□□□ 1.51
TSNARE1-205ENST00000520166 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-205ENST00000520166 MROH2AA6NES4 1674 aa24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-205ENST00000520166 PIK3C2BO00750 1634 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-205ENST00000520166 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-205ENST00000520166 TNRQ92752 1358 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-205ENST00000520166 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.42■■□□□ 1.5
TSNARE1-205ENST00000520166 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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TSNARE1-205ENST00000520166 ADGRB3O60242 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
TSNARE1-205ENST00000520166 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.39■■□□□ 1.49
TSNARE1-205ENST00000520166 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
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TSNARE1-205ENST00000520166 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.35■■□□□ 1.49
TSNARE1-205ENST00000520166 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.32■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.3■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 IFT172Q9UG01 1749 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-205ENST00000520166 PPLO60437 1756 aa24.26■■□□□ 1.47
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