RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517886.1

CHCHD10-203, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10, human

TSL 3

Gene CHCHD10, Length 494 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHCHD10-203	ENST00000517886	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		30.45	■■■□□ 2.47
CHCHD10-203	ENST00000517886	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.45	■■■□□ 2.46
CHCHD10-203	ENST00000517886	ROCK1	Q13464	1354 aa		30.43	■■■□□ 2.46
CHCHD10-203	ENST00000517886	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		30.42	■■■□□ 2.46
CHCHD10-203	ENST00000517886	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	30.38	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	30.38	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		30.37	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.37	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		30.36	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		30.35	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.35	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.33	■■■□□ 2.45
CHCHD10-203	ENST00000517886	C3	P01024	1663 aa		30.3	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	KANK1	Q14678	1352 aa		30.29	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	30.27	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		30.27	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	30.27	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	NPAT	Q14207	1427 aa		30.27	■■■□□ 2.44
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCC3	O15438	1527 aa		30.26	■■■□□ 2.43
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
CHCHD10-203	ENST00000517886	DEPDC5	O75140	1603 aa		30.23	■■■□□ 2.43
CHCHD10-203	ENST00000517886	PZP	P20742	1482 aa		30.2	■■■□□ 2.43
CHCHD10-203	ENST00000517886	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		30.2	■■■□□ 2.42
CHCHD10-203	ENST00000517886	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		30.19	■■■□□ 2.42
CHCHD10-203	ENST00000517886	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	30.15	■■■□□ 2.42
CHCHD10-203	ENST00000517886	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		30.14	■■■□□ 2.42
CHCHD10-203	ENST00000517886	HFM1	A2PYH4	1435 aa		30.13	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	NAIP	Q13075	1403 aa		30.13	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		30.13	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		30.13	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		30.11	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		30.11	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	CEP152	O94986	1710 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	TNR	Q92752	1358 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	UNC13B	O14795	1591 aa		30.1	■■■□□ 2.41
CHCHD10-203	ENST00000517886	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		30.06	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	NUP155	O75694	1391 aa		30.05	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	HSPA2	P54652	639 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	ERVK-7	P63135	1459 aa		30.04	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		30.03	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		30.01	■■■□□ 2.4
CHCHD10-203	ENST00000517886	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		30.01	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.99	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	TET3	O43151	1660 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CHCHD10-203	ENST00000517886	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.38
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRIM52	Q96A61	297 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CHCHD10-203	ENST00000517886	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
CHCHD10-203	ENST00000517886	NOS1	P29475	1434 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CHCHD10-203	ENST00000517886	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CHCHD10-203	ENST00000517886	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
CHCHD10-203	ENST00000517886	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CHCHD10-203	ENST00000517886	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CHCHD10-203	ENST00000517886	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CHCHD10-203	ENST00000517886	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CHCHD10-203	ENST00000517886	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886		E9PCH4	1651 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	SYNM	O15061	1565 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	PKD2	Q13563	968 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	IDI1	Q13907	227 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CHCHD10-203	ENST00000517886	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	PTPRT	O14522	1441 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	HRC	P23327	699 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CHCHD10-203	ENST00000517886	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	ADGRB3	O60242	1522 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	EID1	Q9Y6B2	187 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	SLIT1	O75093	1534 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CHCHD10-203	ENST00000517886	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		29.63	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRPM2	O94759	1503 aa		29.62	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.6	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
CHCHD10-203	ENST00000517886	MED14	O60244	1454 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.57	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	FOXD1	Q16676	465 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		29.56	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	LTK	P29376	864 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CHCHD10-203	ENST00000517886	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	29.51	■■■□□ 2.31
CHCHD10-203	ENST00000517886	CLTCL1	P53675	1640 aa		29.51	■■■□□ 2.31
CHCHD10-203	ENST00000517886	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		29.51	■■■□□ 2.31
CHCHD10-203	ENST00000517886	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.49	■■■□□ 2.31
CHCHD10-203	ENST00000517886	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.49	■■■□□ 2.31

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