RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514669.5

CTBP1-216, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 809 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-216ENST00000514669 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.95■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 GGT6Q6P531 493 aa25.95■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.94■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 HFM1A2PYH4 1435 aa25.92■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.92■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 NAIPQ13075 1403 aa25.91■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.91■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 MROH2AA6NES4 1674 aa25.91■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.9■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CTBP1-216ENST00000514669 UNC13BO14795 1591 aa25.88■■□□□ 1.73
CTBP1-216ENST00000514669 PTPRMP28827 1452 aa25.88■■□□□ 1.73
CTBP1-216ENST00000514669 CEP152O94986 1710 aa25.86■■□□□ 1.73
CTBP1-216ENST00000514669 C3P01024 1663 aa25.84■■□□□ 1.73
CTBP1-216ENST00000514669 ABCC3O15438 1527 aa25.83■■□□□ 1.73
CTBP1-216ENST00000514669 KANK1Q14678 1352 aa25.82■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.82■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.81■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.8■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.724e-7■■■□□ 14.9
CTBP1-216ENST00000514669 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 ZMYM3Q14202 1370 aa25.77■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.77■■□□□ 1.72
CTBP1-216ENST00000514669 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.75■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 TET3O43151 1660 aa25.73■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 PZPP20742 1482 aa25.72■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.71■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.71■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 NUP155O75694 1391 aa25.7■■□□□ 1.71
CTBP1-216ENST00000514669 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.69■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 NPATQ14207 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.66■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.64■■□□□ 1.7
CTBP1-216ENST00000514669 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 TRIM52Q96A61 297 aa25.63■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.63■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 E9PCH4 1651 aa25.62■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 ERVK-7P63135 1459 aa25.62■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CTBP1-216ENST00000514669 TNRQ92752 1358 aa25.57■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 HRCP23327 699 aa25.57■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.55■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 NOS1P29475 1434 aa25.53■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.51■■□□□ 1.68
CTBP1-216ENST00000514669 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.51■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 SYNMO15061 1565 aa25.51■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 NLRP1Q9C000 1473 aa25.5■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.47■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 PKD2Q13563 968 aa25.46■■□□□ 1.67
CTBP1-216ENST00000514669 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.45■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 PIK3C2BO00750 1634 aa25.43■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 PTPRTO14522 1441 aa25.43■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 TRPM2O94759 1503 aa25.42■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.4■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.39■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.39■■□□□ 1.66
CTBP1-216ENST00000514669 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.37■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 ADGRB3O60242 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 CLTCL1P53675 1640 aa25.35■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 IDI1Q13907 227 aa25.35■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 PLA2R1Q13018 1463 aa25.34■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 FOXD1Q16676 465 aa25.34■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 HSPA2P54652 639 aa25.33■■□□□ 1.65
CTBP1-216ENST00000514669 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.32■■□□□ 1.64
CTBP1-216ENST00000514669 KIF1BO60333 1816 aa25.31■■□□□ 1.64
CTBP1-216ENST00000514669 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.3■■□□□ 1.64
CTBP1-216ENST00000514669 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTBP1-216ENST00000514669 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.29■■□□□ 1.64
CTBP1-216ENST00000514669 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.26■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 STRCQ7RTU9 1775 aa25.26■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 SLIT1O75093 1534 aa25.25■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.23■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.23■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.2■■□□□ 1.63
CTBP1-216ENST00000514669 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.17■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.16■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.14■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 ZFYVE9O95405 1425 aa25.14■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.14■■□□□ 1.62
CTBP1-216ENST00000514669 EID1Q9Y6B2 187 aa25.13■■□□□ 1.61
CTBP1-216ENST00000514669 MED14O60244 1454 aa25.12■■□□□ 1.61
CTBP1-216ENST00000514669 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.3 ms