RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.02	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	NUP160	Q12769	1436 aa		7.01	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ERCC6	Q03468	1493 aa		6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.99	□□□□□ -1.29	2e-8	■■□□□ 12.5
IFT122-231	ENST00000514275	IFNL1	Q8IU54	200 aa		6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	CEP170	Q5SW79	1584 aa		6.99	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	NCOA1	Q15788	1441 aa		6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ATP10B	O94823	1461 aa		6.97	□□□□□ -1.29
IFT122-231	ENST00000514275	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ADGRL2	O95490	1459 aa		6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	PZP	P20742	1482 aa		6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ABCA8	O94911	1581 aa		6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TRPC6	Q9Y210	931 aa		6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.95	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		6.94	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		6.94	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.94	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	STK25	O00506	426 aa		6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	PTPRG	P23470	1445 aa		6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		6.93	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TSPY4	P0CV99	314 aa		6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TSPY10	P0CW01	314 aa		6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	PSEN1	P49768	467 aa		6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	KIF14	Q15058	1648 aa		6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		6.91	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		6.9	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	STK24	Q9Y6E0	443 aa		6.9	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		6.9	□□□□□ -1.3
IFT122-231	ENST00000514275	MBD5	Q9P267	1494 aa		6.9	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	NUP155	O75694	1391 aa		6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		6.89	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		6.88	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.88	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	GABBR2	O75899	941 aa		6.88	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		6.88	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.87	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		6.87	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	NEFL	P07196	543 aa		6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	KIF15	Q9NS87	1388 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	CLCN6	P51797	869 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	PLCB2	Q00722	1185 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	BCAN	Q96GW7	911 aa		6.85	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	USP47	Q96K76	1375 aa		6.84	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		6.84	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	TIE1	P35590	1138 aa		6.84	□□□□□ -1.31
IFT122-231	ENST00000514275	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31

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