RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-215ENST00000514153 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.48■■■■■ 4.71
FAM149A-215ENST00000514153 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
FAM149A-215ENST00000514153 A2MP01023 1474 aa44.45■■■■■ 4.71
FAM149A-215ENST00000514153 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.43■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 KIF3BO15066 747 aa44.42■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.4■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa44.4■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.39■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.39■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
FAM149A-215ENST00000514153 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.38■■■■■ 4.69
FAM149A-215ENST00000514153 DEPDC5O75140 1603 aa44.35■■■■■ 4.69
FAM149A-215ENST00000514153 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.26■■■■■ 4.68
FAM149A-215ENST00000514153 TONSLQ96HA7 1378 aa44.25■■■■■ 4.67
FAM149A-215ENST00000514153 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
FAM149A-215ENST00000514153 KANK1Q14678 1352 aa44.2■■■■■ 4.67
FAM149A-215ENST00000514153 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa44.19■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.17■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 GGT6Q6P531 493 aa44.15■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.14■■■■■ 4.66
FAM149A-215ENST00000514153 ATP10AO60312 1499 aa44.12■■■■■ 4.65
FAM149A-215ENST00000514153 E9PCH4 1651 aa44.09■■■■■ 4.65
FAM149A-215ENST00000514153 TET3O43151 1660 aa44.08■■■■■ 4.65
FAM149A-215ENST00000514153 CEP152O94986 1710 aa44.05■■■■■ 4.64
FAM149A-215ENST00000514153 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.04■■■■■ 4.64
FAM149A-215ENST00000514153 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
FAM149A-215ENST00000514153 PLA2R1Q13018 1463 aa44.03■■■■■ 4.64
FAM149A-215ENST00000514153 L3MBTL2Q969R5 705 aa43.99■■■■■ 4.63
FAM149A-215ENST00000514153 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.97■■■■■ 4.63
FAM149A-215ENST00000514153 REREQ9P2R6 1566 aa43.97■■■■■ 4.63
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.94■■■■■ 4.63
FAM149A-215ENST00000514153 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.94■■■■■ 4.62
FAM149A-215ENST00000514153 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.94■■■■■ 4.62
FAM149A-215ENST00000514153 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.94■■■■■ 4.62
FAM149A-215ENST00000514153 ABCC3O15438 1527 aa43.91■■■■■ 4.62
FAM149A-215ENST00000514153 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.88■■■■■ 4.61
FAM149A-215ENST00000514153 AGLP35573 1532 aa43.86■■■■■ 4.61
FAM149A-215ENST00000514153 PTPRTO14522 1441 aa43.81■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 TRPM2O94759 1503 aa43.81■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.81■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 NPATQ14207 1427 aa43.78■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 MLECQ14165 292 aa43.78■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
FAM149A-215ENST00000514153 CLTCL1P53675 1640 aa43.72■■■■■ 4.59
FAM149A-215ENST00000514153 RGL3Q3MIN7 710 aa43.71■■■■■ 4.59
FAM149A-215ENST00000514153 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
FAM149A-215ENST00000514153 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.69■■■■■ 4.58
FAM149A-215ENST00000514153 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.66■■■■■ 4.58
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 DCAF11Q8TEB1 546 aa43.63■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa43.63■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.59■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.57■■■■■ 4.57
FAM149A-215ENST00000514153 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.57■■■■■ 4.56
FAM149A-215ENST00000514153 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.54■■■■■ 4.56
FAM149A-215ENST00000514153 NOS1P29475 1434 aa43.51■■■■■ 4.56
FAM149A-215ENST00000514153 SYNMO15061 1565 aa43.49■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 KIF1BO60333 1816 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.45■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
FAM149A-215ENST00000514153 MROH2AA6NES4 1674 aa43.41■■■■■ 4.54
FAM149A-215ENST00000514153 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
FAM149A-215ENST00000514153 PIK3C2BO00750 1634 aa43.37■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 ERVK-7P63135 1459 aa43.37■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.36■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.34■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 ADGRB3O60242 1522 aa43.34■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 ZMYM3Q14202 1370 aa43.33■■■■■ 4.53
FAM149A-215ENST00000514153 IDI1Q13907 227 aa43.3■■■■■ 4.52
FAM149A-215ENST00000514153 RALGAPBQ86X10 1494 aa43.3■■■■■ 4.52
FAM149A-215ENST00000514153 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.26■■■■■ 4.52
FAM149A-215ENST00000514153 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa43.24■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.24■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP43.24■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 MADDQ8WXG6 1647 aa43.21■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 IFT172Q9UG01 1749 aa43.2■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.2■■■■■ 4.51
FAM149A-215ENST00000514153 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
FAM149A-215ENST00000514153 CARD11Q9BXL7 1154 aa43.17■■■■■ 4.5
FAM149A-215ENST00000514153 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.15■■■■■ 4.5
FAM149A-215ENST00000514153 NBPF1Q3BBV0 1214 aa43.15■■■■■ 4.5
FAM149A-215ENST00000514153 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.12■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 PPLO60437 1756 aa43.12■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 STAC3Q96MF2 364 aa43.12■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 MYOM2P54296 1465 aa43.11■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.11■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 USP47Q96K76 1375 aa43.1■■■■■ 4.49
FAM149A-215ENST00000514153 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.09■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms