RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498979.6

USP2-AS1-201, Transcript of USP2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP2-AS1, Length 2,486 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2-AS1-201ENST00000498979 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.52□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 26.9
USP2-AS1-201ENST00000498979 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.52□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.51□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.51□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.51□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.51□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.51□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 NEO1Q92859 1461 aa12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 KDM6BO15054 1643 aa12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 NCOA1Q15788 1441 aa12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 ROCK1Q13464 1354 aa12.49□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.48□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.48□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.47□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 CCDC7Q96M83 1385 aa12.47□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.47□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 PLEKHG5O94827 1062 aa12.47□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.46□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.46□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.46□□□□□ -0.41
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIF15Q9NS87 1388 aa12.46□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 PKNOX2Q96KN3 472 aa12.46□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ADGRL2O95490 1459 aa12.46□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 MSH5O43196 834 aa12.45□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa12.45□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.45□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 RICTORQ6R327 1708 aa12.44□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.44□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.44□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.44□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.43□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.43□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.43□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ATP7AQ04656 1500 aa12.43□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.42□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.42□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 KDM5CP41229 1560 aa12.42□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.42□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.4□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.4□□□□□ -0.42
USP2-AS1-201ENST00000498979 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.39□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.39□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 PLXNC1O60486 1568 aa12.38□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 ABCA6Q8N139 1617 aa12.38□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 ARXQ96QS3 562 aa12.37□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIF3BO15066 747 aa12.36□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.36□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 MRS2Q9HD23 443 aa12.36□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.36□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.35□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.35□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa12.34□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 A2MP01023 1474 aa12.34□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 NUP155O75694 1391 aa12.33□□□□□ -0.43
USP2-AS1-201ENST00000498979 KIF7Q2M1P5 1343 aa12.33□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.33□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 CCDC184Q52MB2 194 aa12.32□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 GGT6Q6P531 493 aa12.32□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.32□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 PZPP20742 1482 aa12.31□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 ERBINQ96RT1 1412 aa12.31□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 MLECQ14165 292 aa12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 ATP10AO60312 1499 aa12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 NUDCQ9Y266 331 aa12.3□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.29□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.29□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 PKD2Q13563 968 aa12.28□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.27□□□□□ -0.44
USP2-AS1-201ENST00000498979 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.27□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 UNC13BO14795 1591 aa12.26□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.25□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.25□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.24□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 DEPDC5O75140 1603 aa12.24□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP2-AS1-201ENST00000498979 KCNA4P22459 653 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.1 ms