RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.73■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.72■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.71■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.7■■□□□ 1.23
PFKL-211ENST00000498841 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.68■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.67■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.65■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 SHROOM2Q13796 1616 aa22.65■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 KIF3BO15066 747 aa22.65■■□□□ 1.22
PFKL-211ENST00000498841 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.63■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.63■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 TMC1Q8TDI8 760 aa22.62■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 PLCH2O75038 1416 aa22.6■■□□□ 1.21
PFKL-211ENST00000498841 PLA2R1Q13018 1463 aa22.57■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 KDM5CP41229 1560 aa22.55■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.54■■□□□ 1.2
PFKL-211ENST00000498841 GGT6Q6P531 493 aa22.51■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 A2MP01023 1474 aa22.5■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 OSCARQ8IYS5 282 aa22.48■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.48■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 FANCAO15360 1455 aa22.48■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.48■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.47■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.47■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.46■■□□□ 1.19
PFKL-211ENST00000498841 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.45■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 PANK3Q9H999 370 aa22.45■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 ASXL2Q76L83 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 ABCC1P33527 1531 aa22.45■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.44■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.44■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 ADGRL1O94910 1474 aa22.43■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.42■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 RAPGEF3O95398 923 aa22.41■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 NBR1Q14596 966 aa22.41■■□□□ 1.18
PFKL-211ENST00000498841 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 UNC13BO14795 1591 aa22.38■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 TESK2Q96S53 571 aa22.37■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.37■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 ERBINQ96RT1 1412 aa22.37■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.37■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.37■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.36■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 TMF1P82094 1093 aa22.36■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.36■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 PLXNC1O60486 1568 aa22.35■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 KANK1Q14678 1352 aa22.35■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.34■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PFKL-211ENST00000498841 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.33■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.32■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 ATP7AQ04656 1500 aa22.3■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.3■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.29■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 ATP10AO60312 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 E9PCH4 1651 aa22.28■■□□□ 1.16
PFKL-211ENST00000498841 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 RALBP1Q15311 655 aa22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 CD109Q6YHK3 1445 aa22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.26■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 NLRP13Q86W25 1043 aa22.25■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.25■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 NUDCQ9Y266 331 aa22.25■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.25■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.24■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 CLTCL1P53675 1640 aa22.21■■□□□ 1.15
PFKL-211ENST00000498841 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.19■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.18■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.17■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.17■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 PLIN1O60240 522 aa22.15■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.15■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 MLECQ14165 292 aa22.15■■□□□ 1.14
PFKL-211ENST00000498841 STK26Q9P289 416 aa22.14■■□□□ 1.14
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