RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497146.5

PTGER3-211, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,971 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-211ENST00000497146 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.35■■■□□ 2.45
PTGER3-211ENST00000497146 ATP10AO60312 1499 aa30.34■■■□□ 2.45
PTGER3-211ENST00000497146 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.34■■■□□ 2.45
PTGER3-211ENST00000497146 KDM5CP41229 1560 aa30.31■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.3■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 NEO1Q92859 1461 aa30.3■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.3■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.28■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PTGER3-211ENST00000497146 KANK1Q14678 1352 aa30.26■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 PLA2R1Q13018 1463 aa30.26■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.25■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 TET3O43151 1660 aa30.25■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.24■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 E9PCH4 1651 aa30.23■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.22■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 GLI2P10070 1586 aa30.22■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
PTGER3-211ENST00000497146 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
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PTGER3-211ENST00000497146 TRPM2O94759 1503 aa30.17■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 A2MP01023 1474 aa30.16■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 ANP32CO43423 234 aa30.16■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.15■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.15■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 KIF3BO15066 747 aa30.15■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 USP47Q96K76 1375 aa30.14■■■□□ 2.42
PTGER3-211ENST00000497146 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.11■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 CCDC7Q96M83 1385 aa30.1■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.1■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 PTPRTO14522 1441 aa30.09■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 CCER2I3L3R5 266 aa30.09■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.09■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 CEP152O94986 1710 aa30.08■■■□□ 2.41
PTGER3-211ENST00000497146 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.07■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 ABCA6Q8N139 1617 aa30.07■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.06■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 DIP2BQ9P265 1576 aa30.06■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.06■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 RICTORQ6R327 1708 aa30.06■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.05■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.05■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.04■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 RGL3Q3MIN7 710 aa30.03■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.02■■■□□ 2.4
PTGER3-211ENST00000497146 LAMC1P11047 1609 aa30.01■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 NEURL4Q96JN8 1562 aa30■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 CLTCL1P53675 1640 aa30■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.97■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.97■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 STAC3Q96MF2 364 aa29.96■■■□□ 2.39
PTGER3-211ENST00000497146 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.95■■■□□ 2.38
PTGER3-211ENST00000497146 RAPGEF3O95398 923 aa29.94■■■□□ 2.38
PTGER3-211ENST00000497146 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.94■■■□□ 2.38
PTGER3-211ENST00000497146 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.91■■■□□ 2.38
PTGER3-211ENST00000497146 KIF1BO60333 1816 aa29.89■■■□□ 2.38
PTGER3-211ENST00000497146 MADDQ8WXG6 1647 aa29.88■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.85■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 ABCC3O15438 1527 aa29.85■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.84■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 TSPOAP1O95153 1857 aa29.84■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 GGT6Q6P531 493 aa29.83■■■□□ 2.37
PTGER3-211ENST00000497146 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.82■■■□□ 2.36
PTGER3-211ENST00000497146 NPATQ14207 1427 aa29.81■■■□□ 2.36
PTGER3-211ENST00000497146 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.79■■■□□ 2.36
PTGER3-211ENST00000497146 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.78■■■□□ 2.36
PTGER3-211ENST00000497146 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
PTGER3-211ENST00000497146 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.77■■■□□ 2.36
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PTGER3-211ENST00000497146 IFT172Q9UG01 1749 aa29.75■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.74■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 ADGRB3O60242 1522 aa29.73■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 REREQ9P2R6 1566 aa29.72■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.72■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 MROH2AA6NES4 1674 aa29.72■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.71■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 IQGAP1P46940 1657 aa29.71■■■□□ 2.35
PTGER3-211ENST00000497146 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PTGER3-211ENST00000497146 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
PTGER3-211ENST00000497146 NOS1P29475 1434 aa29.66■■■□□ 2.34
PTGER3-211ENST00000497146 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
PTGER3-211ENST00000497146 PIK3C2BO00750 1634 aa29.64■■■□□ 2.33
PTGER3-211ENST00000497146 TESK2Q96S53 571 aa29.63■■■□□ 2.33
PTGER3-211ENST00000497146 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.63■■■□□ 2.33
PTGER3-211ENST00000497146 AGLP35573 1532 aa29.63■■■□□ 2.33
PTGER3-211ENST00000497146 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
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