RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489736.5

CP-211, Transcript of ceruloplasmin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 1,756 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CP-211ENST00000489736 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.5□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.49□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 NUP155O75694 1391 aa9.49□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.49□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 A2MP01023 1474 aa9.49□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.48□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.48□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 DEPDC5O75140 1603 aa9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CP-211ENST00000489736 KIF3BO15066 747 aa9.45□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 NEUROD1Q13562 356 aa9.45□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 PKD2Q13563 968 aa9.45□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.44□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.44□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.44□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.43□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 CEP152O94986 1710 aa9.43□□□□□ -0.9
CP-211ENST00000489736 E9PCH4 1651 aa9.42□□□□□ -0.9
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CP-211ENST00000489736 REREQ9P2R6 1566 aa9.4□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 GGT6Q6P531 493 aa9.4□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 ABCC3O15438 1527 aa9.39□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.39□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 KANK1Q14678 1352 aa9.37□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.37□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.36□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 MLECQ14165 292 aa9.35□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 PTPRTO14522 1441 aa9.34□□□□□ -0.91
CP-211ENST00000489736 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.34□□□□□ -0.91
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CP-211ENST00000489736 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.33□□□□□ -0.92
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CP-211ENST00000489736 SYNMO15061 1565 aa9.32□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 MROH2AA6NES4 1674 aa9.31□□□□□ -0.92
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CP-211ENST00000489736 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.3□□□□□ -0.92
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CP-211ENST00000489736 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 NOS1P29475 1434 aa9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.29□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 RGL3Q3MIN7 710 aa9.28□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.27□□□□□ -0.92
CP-211ENST00000489736 PIK3C2BO00750 1634 aa9.27□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 ERVK-7P63135 1459 aa9.27□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 ADGRB3O60242 1522 aa9.26□□□□□ -0.93
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CP-211ENST00000489736 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.25□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.25□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 KIF1BO60333 1816 aa9.24□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 MADDQ8WXG6 1647 aa9.24□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 ZMYM3Q14202 1370 aa9.24□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.24□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 IFT172Q9UG01 1749 aa9.23□□□□□ -0.93
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CP-211ENST00000489736 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.23□□□□□ -0.93
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CP-211ENST00000489736 IDI1Q13907 227 aa9.22□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.22□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.21□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.21□□□□□ -0.93
CP-211ENST00000489736 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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CP-211ENST00000489736 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.21□□□□□ -0.94
CP-211ENST00000489736 PPLO60437 1756 aa9.2□□□□□ -0.94
CP-211ENST00000489736 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.19□□□□□ -0.94
CP-211ENST00000489736 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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