RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489155.1

PFN2-211, Transcript of profilin 2, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFN2, Length 636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2-211ENST00000489155 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
PFN2-211ENST00000489155 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.1■■■■□ 3.53
PFN2-211ENST00000489155 PTPRMP28827 1452 aa37.09■■■■□ 3.53
PFN2-211ENST00000489155 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.08■■■■□ 3.53
PFN2-211ENST00000489155 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.08■■■■□ 3.53
PFN2-211ENST00000489155 MROH2AA6NES4 1674 aa37.01■■■■□ 3.52
PFN2-211ENST00000489155 DEPDC5O75140 1603 aa36.99■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.99■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.97■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.96■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PFN2-211ENST00000489155 HFM1A2PYH4 1435 aa36.93■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 NAIPQ13075 1403 aa36.93■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.93■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 ZMYM3Q14202 1370 aa36.92■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 KANK1Q14678 1352 aa36.91■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 C3P01024 1663 aa36.91■■■■□ 3.5
PFN2-211ENST00000489155 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.49
PFN2-211ENST00000489155 ABCC3O15438 1527 aa36.88■■■■□ 3.49
PFN2-211ENST00000489155 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PFN2-211ENST00000489155 UNC13BO14795 1591 aa36.85■■■■□ 3.49
PFN2-211ENST00000489155 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.85■■■■□ 3.49
PFN2-211ENST00000489155 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.82■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 CEP152O94986 1710 aa36.82■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.8■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 NPATQ14207 1427 aa36.78■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 PZPP20742 1482 aa36.76■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.76■■■■□ 3.48
PFN2-211ENST00000489155 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.74■■■■□ 3.47
PFN2-211ENST00000489155 NUP155O75694 1391 aa36.71■■■■□ 3.47
PFN2-211ENST00000489155 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.7■■■■□ 3.47
PFN2-211ENST00000489155 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.69■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 TET3O43151 1660 aa36.66■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.65■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.64■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
PFN2-211ENST00000489155 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.6■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 TNRQ92752 1358 aa36.59■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.59■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 ERVK-7P63135 1459 aa36.58■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 TRIM52Q96A61 297 aa36.58■■■■□ 3.45
PFN2-211ENST00000489155 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.55■■■■□ 3.44
PFN2-211ENST00000489155 HRCP23327 699 aa36.54■■■■□ 3.44
PFN2-211ENST00000489155 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.53■■■■□ 3.44
PFN2-211ENST00000489155 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.51■■■■□ 3.43
PFN2-211ENST00000489155 E9PCH4 1651 aa36.5■■■■□ 3.43
PFN2-211ENST00000489155 NOS1P29475 1434 aa36.48■■■■□ 3.43
PFN2-211ENST00000489155 NLRP1Q9C000 1473 aa36.48■■■■□ 3.43
PFN2-211ENST00000489155 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
PFN2-211ENST00000489155 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.44■■■■□ 3.42
PFN2-211ENST00000489155 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PFN2-211ENST00000489155 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
PFN2-211ENST00000489155 SYNMO15061 1565 aa36.38■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 PKD2Q13563 968 aa36.37■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.37■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.36■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 HSPA2P54652 639 aa36.35■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 PTPRTO14522 1441 aa36.33■■■■□ 3.41
PFN2-211ENST00000489155 IDI1Q13907 227 aa36.31■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.31■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.31■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 PIK3C2BO00750 1634 aa36.26■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
PFN2-211ENST00000489155 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.25■■■■□ 3.39
PFN2-211ENST00000489155 PLA2R1Q13018 1463 aa36.24■■■■□ 3.39
PFN2-211ENST00000489155 TRPM2O94759 1503 aa36.22■■■■□ 3.39
PFN2-211ENST00000489155 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.19■■■■□ 3.38
PFN2-211ENST00000489155 ADGRB3O60242 1522 aa36.17■■■■□ 3.38
PFN2-211ENST00000489155 STRCQ7RTU9 1775 aa36.15■■■■□ 3.38
PFN2-211ENST00000489155 FOXD1Q16676 465 aa36.15■■■■□ 3.38
PFN2-211ENST00000489155 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.12■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 SLIT1O75093 1534 aa36.1■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 CLTCL1P53675 1640 aa36.1■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.1■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.1■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.09■■■■□ 3.37
PFN2-211ENST00000489155 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.07■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.06■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.06■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 KIF1BO60333 1816 aa36.04■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.03■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.01■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 EID1Q9Y6B2 187 aa36.01■■■■□ 3.36
PFN2-211ENST00000489155 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.98■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 MED14O60244 1454 aa35.98■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.96■■■■□ 3.35
PFN2-211ENST00000489155 LTKP29376 864 aa35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms