RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483296.5

TIMM23B-204, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM23B, Length 1,156 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23B-204ENST00000483296 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM23B-204ENST00000483296 PTPRMP28827 1452 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM23B-204ENST00000483296 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM23B-204ENST00000483296 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TIMM23B-204ENST00000483296 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TIMM23B-204ENST00000483296 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM23B-204ENST00000483296 KANK1Q14678 1352 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM23B-204ENST00000483296 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMM23B-204ENST00000483296 MROH2AA6NES4 1674 aa25.18■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 ZMYM3Q14202 1370 aa25.17■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 HFM1A2PYH4 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 DEPDC5O75140 1603 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TIMM23B-204ENST00000483296 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.622e-10■■□□□ 13.3
TIMM23B-204ENST00000483296 NAIPQ13075 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 ABCC3O15438 1527 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 NPATQ14207 1427 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 C3P01024 1663 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM23B-204ENST00000483296 PZPP20742 1482 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 UNC13BO14795 1591 aa25.05■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.05■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.03■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 NUP155O75694 1391 aa25.03■■□□□ 1.6
TIMM23B-204ENST00000483296 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 CEP152O94986 1710 aa24.99■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.99■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.98■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.96■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 TNRQ92752 1358 aa24.95■■□□□ 1.59
TIMM23B-204ENST00000483296 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.95■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 TRIM52Q96A61 297 aa24.95■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 TET3O43151 1660 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 ERVK-7P63135 1459 aa24.92■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.91■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 NLRP1Q9C000 1473 aa24.89■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 HRCP23327 699 aa24.89■■□□□ 1.58
TIMM23B-204ENST00000483296 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.86■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 NOS1P29475 1434 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM23B-204ENST00000483296 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TIMM23B-204ENST00000483296 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TIMM23B-204ENST00000483296 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TIMM23B-204ENST00000483296 E9PCH4 1651 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM23B-204ENST00000483296 PKD2Q13563 968 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM23B-204ENST00000483296 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 HSPA2P54652 639 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.75■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 SYNMO15061 1565 aa24.73■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 PLA2R1Q13018 1463 aa24.72■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 PTPRTO14522 1441 aa24.72■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 IDI1Q13907 227 aa24.71■■□□□ 1.55
TIMM23B-204ENST00000483296 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.7■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.67■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 TRPM2O94759 1503 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 PIK3C2BO00750 1634 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 ADGRB3O60242 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMM23B-204ENST00000483296 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.64■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 EID1Q9Y6B2 187 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.6■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.6■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 SLIT1O75093 1534 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 FOXD1Q16676 465 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM23B-204ENST00000483296 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.55■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 STRCQ7RTU9 1775 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.54■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 CLTCL1P53675 1640 aa24.53■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TIMM23B-204ENST00000483296 MED14O60244 1454 aa24.51■■□□□ 1.51
TIMM23B-204ENST00000483296 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TIMM23B-204ENST00000483296 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.5■■□□□ 1.51
TIMM23B-204ENST00000483296 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TIMM23B-204ENST00000483296 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms