RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	NUP155	O75694	1391 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	KANK1	Q14678	1352 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	GGT6	Q6P531	493 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	UNC13B	O14795	1591 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MLEC	Q14165	292 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP4-208	ENST00000462602	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	PZP	P20742	1482 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	PKD2	Q13563	968 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP4-208	ENST00000462602	ABCC3	O15438	1527 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	TET3	O43151	1660 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOXD1	Q16676	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEP152	O94986	1710 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPAT	Q14207	1427 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTPRT	O14522	1441 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602		E9PCH4	1651 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	NOS1	P29475	1434 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRPM2	O94759	1503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNR	Q92752	1358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTPRM	P28827	1452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	C3	P01024	1663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	IDI1	Q13907	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYNM	O15061	1565 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SH3BP4-208	ENST00000462602	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF1B	O60333	1816 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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