RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461142.3

UBE2J2-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 J2, human

TSL 3

Gene UBE2J2, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2J2-209	ENST00000461142	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.99	■■■□□ 2.87
UBE2J2-209	ENST00000461142	GGT6	Q6P531	493 aa		32.99	■■■□□ 2.87
UBE2J2-209	ENST00000461142	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
UBE2J2-209	ENST00000461142	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.96	■■■□□ 2.87
UBE2J2-209	ENST00000461142	NAIP	Q13075	1403 aa		32.96	■■■□□ 2.87
UBE2J2-209	ENST00000461142	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	PTPRM	P28827	1452 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	UNC13B	O14795	1591 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	ABCC3	O15438	1527 aa		32.87	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	CEP152	O94986	1710 aa		32.86	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.85	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.85	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	C3	P01024	1663 aa		32.84	■■■□□ 2.85
UBE2J2-209	ENST00000461142	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
UBE2J2-209	ENST00000461142	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.79	■■■□□ 2.84
UBE2J2-209	ENST00000461142	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBE2J2-209	ENST00000461142	KANK1	Q14678	1352 aa		32.78	■■■□□ 2.84
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.75	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.74	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.72	■■■□□ 2.83
UBE2J2-209	ENST00000461142	PZP	P20742	1482 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.69	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	TET3	O43151	1660 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	NUP155	O75694	1391 aa		32.68	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.64	■■■□□ 2.82
UBE2J2-209	ENST00000461142	NPAT	Q14207	1427 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBE2J2-209	ENST00000461142	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UBE2J2-209	ENST00000461142	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UBE2J2-209	ENST00000461142		E9PCH4	1651 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
UBE2J2-209	ENST00000461142	TNR	Q92752	1358 aa		32.5	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.47	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	SYNM	O15061	1565 aa		32.46	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	NOS1	P29475	1434 aa		32.45	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.45	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
UBE2J2-209	ENST00000461142	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	HRC	P23327	699 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.39	■■■□□ 2.78
UBE2J2-209	ENST00000461142	PKD2	Q13563	968 aa		32.38	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.36	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.36	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	PTPRT	O14522	1441 aa		32.34	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.33	■■■□□ 2.77
UBE2J2-209	ENST00000461142	TRPM2	O94759	1503 aa		32.31	■■■□□ 2.76
UBE2J2-209	ENST00000461142	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.3	■■■□□ 2.76
UBE2J2-209	ENST00000461142	FOXD1	Q16676	465 aa		32.29	■■■□□ 2.76
UBE2J2-209	ENST00000461142	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.29	■■■□□ 2.76
UBE2J2-209	ENST00000461142	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
UBE2J2-209	ENST00000461142	HSPA2	P54652	639 aa		32.26	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.26	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.25	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	IDI1	Q13907	227 aa		32.23	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.22	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
UBE2J2-209	ENST00000461142	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.17	■■■□□ 2.74
UBE2J2-209	ENST00000461142	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.17	■■■□□ 2.74
UBE2J2-209	ENST00000461142	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.11	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.1	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	KIF1B	O60333	1816 aa		32.1	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.09	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.09	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	SLIT1	O75093	1534 aa		32.08	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.08	■■■□□ 2.73
UBE2J2-209	ENST00000461142	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
UBE2J2-209	ENST00000461142	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.05	■■■□□ 2.72
UBE2J2-209	ENST00000461142	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.02	■■■□□ 2.72
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32	■■■□□ 2.71
UBE2J2-209	ENST00000461142	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32	■■■□□ 2.71
UBE2J2-209	ENST00000461142	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
UBE2J2-209	ENST00000461142	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.97	■■■□□ 2.71
UBE2J2-209	ENST00000461142	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.96	■■■□□ 2.71
UBE2J2-209	ENST00000461142	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.94	■■■□□ 2.7
UBE2J2-209	ENST00000461142	LTK	P29376	864 aa		31.93	■■■□□ 2.7
UBE2J2-209	ENST00000461142	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.93	■■■□□ 2.7

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