RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438576.2

C11orf68-201, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf68, Length 1,619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-201ENST00000438576 ERBINQ96RT1 1412 aa43.86■■■■■ 4.61
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C11orf68-201ENST00000438576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
C11orf68-201ENST00000438576 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.77■■■■■ 4.6
C11orf68-201ENST00000438576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
C11orf68-201ENST00000438576 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.76■■■■■ 4.6
C11orf68-201ENST00000438576 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.76■■■■■ 4.6
C11orf68-201ENST00000438576 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
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C11orf68-201ENST00000438576 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.72■■■■■ 4.59
C11orf68-201ENST00000438576 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
C11orf68-201ENST00000438576 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.67■■■■■ 4.58
C11orf68-201ENST00000438576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.65■■■■■ 4.58
C11orf68-201ENST00000438576 ZMYM3Q14202 1370 aa43.65■■■■■ 4.58
C11orf68-201ENST00000438576 DEPDC5O75140 1603 aa43.63■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.62■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 C3P01024 1663 aa43.62■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 MROH2AA6NES4 1674 aa43.61■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 NAIPQ13075 1403 aa43.61■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.58■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 ABCC3O15438 1527 aa43.57■■■■■ 4.57
C11orf68-201ENST00000438576 HFM1A2PYH4 1435 aa43.55■■■■■ 4.56
C11orf68-201ENST00000438576 CEP152O94986 1710 aa43.51■■■■■ 4.56
C11orf68-201ENST00000438576 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.51■■■■■ 4.56
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C11orf68-201ENST00000438576 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.48■■■■■ 4.55
C11orf68-201ENST00000438576 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
C11orf68-201ENST00000438576 UNC13BO14795 1591 aa43.45■■■■■ 4.55
C11orf68-201ENST00000438576 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
C11orf68-201ENST00000438576 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.4■■■■■ 4.54
C11orf68-201ENST00000438576 PZPP20742 1482 aa43.39■■■■■ 4.54
C11orf68-201ENST00000438576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.37■■■■■ 4.53
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C11orf68-201ENST00000438576 NPATQ14207 1427 aa43.36■■■■■ 4.53
C11orf68-201ENST00000438576 NUP155O75694 1391 aa43.35■■■■■ 4.53
C11orf68-201ENST00000438576 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.29■■■■■ 4.52
C11orf68-201ENST00000438576 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.28■■■■■ 4.52
C11orf68-201ENST00000438576 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.27■■■■■ 4.52
C11orf68-201ENST00000438576 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.26■■■■■ 4.52
C11orf68-201ENST00000438576 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.25■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.25■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 TET3O43151 1660 aa43.22■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 TNRQ92752 1358 aa43.22■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 ERVK-7P63135 1459 aa43.21■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.21■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 TRIM52Q96A61 297 aa43.21■■■■■ 4.51
C11orf68-201ENST00000438576 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.19■■■■■ 4.5
C11orf68-201ENST00000438576 HSPA2P54652 639 aa43.15■■■■■ 4.5
C11orf68-201ENST00000438576 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.14■■■■■ 4.5
C11orf68-201ENST00000438576 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.14■■■■■ 4.5
C11orf68-201ENST00000438576 E9PCH4 1651 aa43.11■■■■■ 4.49
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C11orf68-201ENST00000438576 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
C11orf68-201ENST00000438576 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.01■■■■■ 4.48
C11orf68-201ENST00000438576 NLRP1Q9C000 1473 aa43.01■■■■■ 4.48
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C11orf68-201ENST00000438576 SYNMO15061 1565 aa43.01■■■■■ 4.48
C11orf68-201ENST00000438576 PKD2Q13563 968 aa42.97■■■■■ 4.47
C11orf68-201ENST00000438576 IDI1Q13907 227 aa42.93■■■■■ 4.46
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C11orf68-201ENST00000438576 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.86■■■■■ 4.45
C11orf68-201ENST00000438576 PTPRTO14522 1441 aa42.85■■■■■ 4.45
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C11orf68-201ENST00000438576 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.83■■■■■ 4.45
C11orf68-201ENST00000438576 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.81■■■■■ 4.44
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C11orf68-201ENST00000438576 PLA2R1Q13018 1463 aa42.79■■■■■ 4.44
C11orf68-201ENST00000438576 STRCQ7RTU9 1775 aa42.78■■■■■ 4.44
C11orf68-201ENST00000438576 STAG3Q9UJ98 1225 aa42.75■■■■■ 4.43
C11orf68-201ENST00000438576 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.72■■■■■ 4.43
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C11orf68-201ENST00000438576 CLTCL1P53675 1640 aa42.66■■■■■ 4.42
C11orf68-201ENST00000438576 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.64■■■■■ 4.42
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C11orf68-201ENST00000438576 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.61■■■■■ 4.41
C11orf68-201ENST00000438576 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.61■■■■■ 4.41
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.6■■■■■ 4.41
C11orf68-201ENST00000438576 SLIT1O75093 1534 aa42.59■■■■■ 4.41
C11orf68-201ENST00000438576 LTKP29376 864 aa42.57■■■■■ 4.4
C11orf68-201ENST00000438576 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
C11orf68-201ENST00000438576 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.54■■■■■ 4.4
C11orf68-201ENST00000438576 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.53■■■■■ 4.4
C11orf68-201ENST00000438576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.53■■■■■ 4.4
C11orf68-201ENST00000438576 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.5■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 EID1Q9Y6B2 187 aa42.48■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 KIF1BO60333 1816 aa42.48■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.47■■■■■ 4.39
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