RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429260.6

C9orf116-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf116, Length 678 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-205ENST00000429260 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.64■■□□□ 1.21
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C9orf116-205ENST00000429260 GGT6Q6P531 493 aa22.62■■□□□ 1.21
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C9orf116-205ENST00000429260 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.56■■□□□ 1.2
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C9orf116-205ENST00000429260 MADDQ8WXG6 1647 aa22.53■■□□□ 1.2
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C9orf116-205ENST00000429260 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.48■■□□□ 1.19
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C9orf116-205ENST00000429260 HFM1A2PYH4 1435 aa22.47■■□□□ 1.19
C9orf116-205ENST00000429260 NAIPQ13075 1403 aa22.47■■□□□ 1.19
C9orf116-205ENST00000429260 KANK1Q14678 1352 aa22.46■■□□□ 1.19
C9orf116-205ENST00000429260 PTPRMP28827 1452 aa22.46■■□□□ 1.19
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C9orf116-205ENST00000429260 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.44■■□□□ 1.18
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C9orf116-205ENST00000429260 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.42■■□□□ 1.18
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C9orf116-205ENST00000429260 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf116-205ENST00000429260 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf116-205ENST00000429260 ZMYM3Q14202 1370 aa22.41■■□□□ 1.18
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C9orf116-205ENST00000429260 DEPDC5O75140 1603 aa22.41■■□□□ 1.18
C9orf116-205ENST00000429260 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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C9orf116-205ENST00000429260 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 ABCC3O15438 1527 aa22.37■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 MROH2AA6NES4 1674 aa22.37■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.37■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 NUP155O75694 1391 aa22.37■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 UNC13BO14795 1591 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 TRIM52Q96A61 297 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 CEP152O94986 1710 aa22.34■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.33■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 C3P01024 1663 aa22.33■■□□□ 1.17
C9orf116-205ENST00000429260 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 PZPP20742 1482 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.28■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 NPATQ14207 1427 aa22.27■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.27■■□□□ 1.16
C9orf116-205ENST00000429260 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.27■■□□□ 1.16
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C9orf116-205ENST00000429260 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.23■■□□□ 1.15
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C9orf116-205ENST00000429260 TNRQ92752 1358 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf116-205ENST00000429260 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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C9orf116-205ENST00000429260 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.17■■□□□ 1.14
C9orf116-205ENST00000429260 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf116-205ENST00000429260 E9PCH4 1651 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf116-205ENST00000429260 NOS1P29475 1434 aa22.13■■□□□ 1.13
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C9orf116-205ENST00000429260 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 NLRP1Q9C000 1473 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 HSPA2P54652 639 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 IDI1Q13907 227 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf116-205ENST00000429260 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.07■■□□□ 1.12
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C9orf116-205ENST00000429260 PTPRTO14522 1441 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf116-205ENST00000429260 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf116-205ENST00000429260 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf116-205ENST00000429260 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf116-205ENST00000429260 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.03■■□□□ 1.12
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C9orf116-205ENST00000429260 PIK3C2BO00750 1634 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf116-205ENST00000429260 PLA2R1Q13018 1463 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf116-205ENST00000429260 TRPM2O94759 1503 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf116-205ENST00000429260 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf116-205ENST00000429260 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf116-205ENST00000429260 ADGRB3O60242 1522 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf116-205ENST00000429260 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.93■■□□□ 1.1
C9orf116-205ENST00000429260 CLTCL1P53675 1640 aa21.92■■□□□ 1.1
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C9orf116-205ENST00000429260 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.91■■□□□ 1.1
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C9orf116-205ENST00000429260 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.9■■□□□ 1.1
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C9orf116-205ENST00000429260 EID1Q9Y6B2 187 aa21.9■■□□□ 1.1
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