RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429260.6

C9orf116-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf116, Length 678 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-205ENST00000429260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.68■■■■□ 3.3
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C9orf116-205ENST00000429260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.58■■□□□ 1.85
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C9orf116-205ENST00000429260 ERCC6Q03468 1493 aa26.46■■□□□ 1.83
C9orf116-205ENST00000429260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.45■■□□□ 1.82
C9orf116-205ENST00000429260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.3■■□□□ 1.8
C9orf116-205ENST00000429260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.28■■□□□ 1.8
C9orf116-205ENST00000429260 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.27■■□□□ 1.8
C9orf116-205ENST00000429260 PRDM2Q13029 1718 aa26.25■■□□□ 1.79
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C9orf116-205ENST00000429260 SYNJ1O43426 1573 aa25.64■■□□□ 1.69
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C9orf116-205ENST00000429260 WDR97A6NE52 1622 aa25.38■■□□□ 1.65
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C9orf116-205ENST00000429260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.95■■□□□ 1.58
C9orf116-205ENST00000429260 GRIN2AQ12879 1464 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf116-205ENST00000429260 EEA1Q15075 1411 aa24.91■■□□□ 1.58
C9orf116-205ENST00000429260 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
C9orf116-205ENST00000429260 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.88■■□□□ 1.57
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C9orf116-205ENST00000429260 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.82■■□□□ 1.56
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