RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.77	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.77	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.77	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POGK	Q9P215	609 aa		13.76	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGS3	P49796	1198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.74	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GLI2	P10070	1586 aa		13.7	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.68	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.67	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.67	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.67	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARX	Q96QS3	562 aa		13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLCH2	O75038	1416 aa		13.66	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.65	□□□□□ -0.22
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.63	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC1	P33527	1531 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TPM2	P07951	284 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAPK1	P53355	1430 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC5	O15440	1437 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ESPN	B1AK53	854 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FANCA	O15360	1455 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEO1	Q92859	1461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLIN1	O60240	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAIP	Q13075	1403 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM5C	P41229	1560 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25

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