RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 JPH4Q96JJ6 628 aa9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 IQGAP2Q13576 1575 aa9.02□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 E9PSI1 815 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF428Q96B54 188 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIF3AQ9Y496 699 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 MORC1Q86VD1 984 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA2Q08379 1002 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 PHF14O94880 888 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 NUP160Q12769 1436 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 GPATCH3Q96I76 525 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 EVC2Q86UK5 1308 aa8.98□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.98□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIF16BQ96L93 1317 aa8.97□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 USP47Q96K76 1375 aa8.97□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
ALMS1-201ENST00000423048 KIF14Q15058 1648 aa8.96□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.95□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.95□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 NSD2O96028 1365 aa8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 TPM4P67936 248 aa8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 EID1Q9Y6B2 187 aa8.92□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 KCNH8Q96L42 1107 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 NESP48681 1621 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 TPM3P06753 285 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 ARID3CA6NKF2 412 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 ABCC11Q96J66 1382 aa8.9□□□□□ -0.98
ALMS1-201ENST00000423048 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 FAM161AQ3B820 660 aa8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.9□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 STK31Q9BXU1 1019 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 MCM2P49736 904 aa8.89□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ST18O60284 1047 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 PDE3AQ14432 1141 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.88□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RGL3Q3MIN7 710 aa8.87□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.87□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 ERBINQ96RT1 1412 aa8.86□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 REC8O95072 547 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RUNDC1Q96C34 613 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 GRIN2AQ12879 1464 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.85□□□□□ -0.99
ALMS1-201ENST00000423048 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms