RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 TRIM52Q96A61 297 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP5-203ENST00000408919 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SH3BP5-203ENST00000408919 AGLP35573 1532 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP5-203ENST00000408919 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP155O75694 1391 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 PZPP20742 1482 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 GGT6Q6P531 493 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-203ENST00000408919 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP152O94986 1710 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 MLECQ14165 292 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5-203ENST00000408919 KANK1Q14678 1352 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCC3O15438 1527 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 TET3O43151 1660 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 FOXD1Q16676 465 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 PKD2Q13563 968 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 E9PCH4 1651 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-203ENST00000408919 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-203ENST00000408919 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-203ENST00000408919 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-203ENST00000408919 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 NPATQ14207 1427 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP5-203ENST00000408919 MADDQ8WXG6 1647 aa26.14■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 PLA2R1Q13018 1463 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 MROH2AA6NES4 1674 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 ZMYM3Q14202 1370 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRTO14522 1441 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP5-203ENST00000408919 C3P01024 1663 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 TRPM2O94759 1503 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 NOS1P29475 1434 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 SYNMO15061 1565 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 NEUROD1Q13562 356 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 ERVK-7P63135 1459 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 CLTCL1P53675 1640 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP5-203ENST00000408919 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP5-203ENST00000408919 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP5-203ENST00000408919 PIK3C2BO00750 1634 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP5-203ENST00000408919 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF1BO60333 1816 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRMP28827 1452 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP5-203ENST00000408919 IDI1Q13907 227 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 TNRQ92752 1358 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 TONSLQ96HA7 1378 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-203ENST00000408919 ADGRB3O60242 1522 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 RGL3Q3MIN7 710 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP5-203ENST00000408919 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 NLRP1Q9C000 1473 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 IFT172Q9UG01 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 PPLO60437 1756 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.7■■□□□ 1.71
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP5-203ENST00000408919 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.62■■□□□ 1.69
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