RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.71■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.7■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A3P48751 1232 aa28.7■■■□□ 2.18
CLDN5-201ENST00000403084 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.69■■■□□ 2.18
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.69■■■□□ 2.18
CLDN5-201ENST00000403084 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.69■■■□□ 2.18
CLDN5-201ENST00000403084 PLIN1O60240 522 aa28.68■■■□□ 2.18
CLDN5-201ENST00000403084 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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CLDN5-201ENST00000403084 FAM161AQ3B820 660 aa28.64■■■□□ 2.17
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CLDN5-201ENST00000403084 C8orf34Q49A92 452 aa28.61■■■□□ 2.17
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CLDN5-201ENST00000403084 ADGRL2O95490 1459 aa28.59■■■□□ 2.17
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CLDN5-201ENST00000403084 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.58■■■□□ 2.17
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CLDN5-201ENST00000403084 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.52■■■□□ 2.16
CLDN5-201ENST00000403084 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.52■■■□□ 2.16
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CLDN5-201ENST00000403084 CEP170Q5SW79 1584 aa28.46■■■□□ 2.15
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CLDN5-201ENST00000403084 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.4■■■□□ 2.14
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.39■■■□□ 2.14
CLDN5-201ENST00000403084 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
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CLDN5-201ENST00000403084 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.35■■■□□ 2.13
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CLDN5-201ENST00000403084 POGKQ9P215 609 aa28.34■■■□□ 2.13
CLDN5-201ENST00000403084 SYNJ2O15056 1496 aa28.33■■■□□ 2.13
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CLDN5-201ENST00000403084 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CLDN5-201ENST00000403084 NUP155O75694 1391 aa28.31■■■□□ 2.12
CLDN5-201ENST00000403084 USP19O94966 1318 aa28.31■■■□□ 2.12
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CLDN5-201ENST00000403084 LAMC1P11047 1609 aa28.31■■■□□ 2.12
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CLDN5-201ENST00000403084 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.27■■■□□ 2.12
CLDN5-201ENST00000403084 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.25■■■□□ 2.11
CLDN5-201ENST00000403084 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
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CLDN5-201ENST00000403084 DISP1Q96F81 1524 aa28.24■■■□□ 2.11
CLDN5-201ENST00000403084 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
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CLDN5-201ENST00000403084 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.22■■■□□ 2.11
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CLDN5-201ENST00000403084 NLRP1Q9C000 1473 aa28.19■■■□□ 2.1
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CLDN5-201ENST00000403084 CLCN1P35523 988 aa28.11■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.11■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 SEC24BO95487 1268 aa28.1■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 IGHDP01880 384 aa28.09■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CLDN5-201ENST00000403084 PPP2R1AP30153 589 aa28.07■■■□□ 2.08
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