RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371953.7

PTEN-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTEN, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-201ENST00000371953 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTEN-201ENST00000371953 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 CUX2O14529 1486 aa20.36■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 TPM1P09493 284 aa20.36■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 USP8P40818 1118 aa20.36■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 HMMRO75330 724 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTEN-201ENST00000371953 H0YHG0 523 aa20.35■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 ZNF592Q92610 1267 aa20.35■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 WIZO95785 1651 aa20.35■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 DEF6Q9H4E7 631 aa20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 SOX12O15370 315 aa20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.33■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTEN-201ENST00000371953 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PTEN-201ENST00000371953 DCTN1Q14203 1278 aa20.33■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 CDR1P51861 262 aa20.32■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 BECN2A8MW95 431 aa20.32■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 PDE4CQ08493 712 aa20.32■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.32■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 GPATCH3Q96I76 525 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTEN-201ENST00000371953 ABCC8Q09428 1581 aa20.3■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.3■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.3■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 MLECQ14165 292 aa20.29■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.28■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.28■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 HOMER1Q86YM7 354 aa20.28■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.27■□□□□ 0.84
PTEN-201ENST00000371953 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.26■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 IFT57Q9NWB7 429 aa20.26■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 NUCB2P80303 420 aa20.25■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 MNS1Q8NEH6 495 aa20.24■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 STK26Q9P289 416 aa20.23■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 FMN1Q68DA7 1419 aa20.22■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTEN-201ENST00000371953 CCP110O43303 1012 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTEN-201ENST00000371953 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTEN-201ENST00000371953 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTEN-201ENST00000371953 KIF15Q9NS87 1388 aa20.18■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 SLC4A3P48751 1232 aa20.18■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.18■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 REC8O95072 547 aa20.17■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 NLRP13Q86W25 1043 aa20.17■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.17■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 UQCRHP07919 91 aa20.17■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 CEP89Q96ST8 783 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 GORABQ5T7V8 394 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.16■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 AAMPQ13685 434 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 ZMYND15Q9H091 742 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 GGT6Q6P531 493 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.15■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 APBB1O00213 710 aa20.14■□□□□ 0.82
PTEN-201ENST00000371953 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.14■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 TRAK2O60296 914 aa20.14■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 INCENPQ9NQS7 918 aa20.14■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 ESPNB1AK53 854 aa20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 KIAA0754O94854 1291 aa20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 H3BQV1 296 aa20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 IFFO2Q5TF58 517 aa20.13■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 STK31Q9BXU1 1019 aa20.12■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 MBD3O95983 291 aa20.12■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.12■□□□□ 0.81
PTEN-201ENST00000371953 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.12■□□□□ 0.81
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