RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.63■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.63■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.63■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 TMC1Q8TDI8 760 aa24.62■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.59■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBQLN4-201ENST00000368309 PLA2R1Q13018 1463 aa24.57■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCC2Q92887 1545 aa24.55■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.53■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 SHROOM2Q13796 1616 aa24.53■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.52■■□□□ 1.52
UBQLN4-201ENST00000368309 NUDCQ9Y266 331 aa24.48■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 PLCH2O75038 1416 aa24.47■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 A2MP01023 1474 aa24.47■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 RALBP1Q15311 655 aa24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 AFAP1Q8N556 730 aa24.46■■□□□ 1.51
UBQLN4-201ENST00000368309 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.44■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 UNC13BO14795 1591 aa24.43■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.41■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 TESK2Q96S53 571 aa24.41■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.4■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
UBQLN4-201ENST00000368309 PLXNC1O60486 1568 aa24.39■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.38■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.37■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 ERBINQ96RT1 1412 aa24.37■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 PANK3Q9H999 370 aa24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 NLRP13Q86W25 1043 aa24.36■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.34■■□□□ 1.49
UBQLN4-201ENST00000368309 TMF1P82094 1093 aa24.32■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.32■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 MSH5O43196 834 aa24.32■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.31■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 ATP10AO60312 1499 aa24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCC1P33527 1531 aa24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.3■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.29■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 E9PCH4 1651 aa24.29■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.28■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UBQLN4-201ENST00000368309 KIF3BO15066 747 aa24.24■■□□□ 1.47
UBQLN4-201ENST00000368309 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.23■■□□□ 1.47
UBQLN4-201ENST00000368309 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.21■■□□□ 1.47
UBQLN4-201ENST00000368309 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.2■■□□□ 1.47
UBQLN4-201ENST00000368309 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.19■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.17■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 LAMC1P11047 1609 aa24.17■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.16■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 FANCAO15360 1455 aa24.16■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.15■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.14■■□□□ 1.46
UBQLN4-201ENST00000368309 KANK1Q14678 1352 aa24.13■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 PTPRTO14522 1441 aa24.12■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 PDE3BQ13370 1112 aa24.11■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.1■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 TRPM2O94759 1503 aa24.1■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 ADGRL1O94910 1474 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 MADDQ8WXG6 1647 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 ATP7AQ04656 1500 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.08■■□□□ 1.45
UBQLN4-201ENST00000368309 CLTCL1P53675 1640 aa24.07■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.07■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 PPP2R1AP30153 589 aa24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 CDCA8Q53HL2 280 aa24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 STAC3Q96MF2 364 aa24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 PLIN1O60240 522 aa24.05■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.04■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 ASXL2Q76L83 1435 aa24.04■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.03■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.02■■□□□ 1.44
UBQLN4-201ENST00000368309 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
UBQLN4-201ENST00000368309 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms