RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.23■□□□□ 0.19
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PTPRK-207ENST00000368226 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.03■□□□□ 0.16
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PTPRK-207ENST00000368226 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRK-207ENST00000368226 PDE3BQ13370 1112 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 USP35Q9P2H5 1018 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 IGF1RP08069 1367 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 E9PSI1 815 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.96■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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PTPRK-207ENST00000368226 ST18O60284 1047 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
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