RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 SHROOM2Q13796 1616 aa23.41■■□□□ 1.34
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TTC13-202ENST00000366662 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC13-202ENST00000366662 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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TTC13-202ENST00000366662 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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TTC13-202ENST00000366662 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.31■■□□□ 1.32
TTC13-202ENST00000366662 TMC1Q8TDI8 760 aa23.3■■□□□ 1.32
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TTC13-202ENST00000366662 A2MP01023 1474 aa23.25■■□□□ 1.31
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TTC13-202ENST00000366662 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.22■■□□□ 1.31
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TTC13-202ENST00000366662 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.15■■□□□ 1.3
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TTC13-202ENST00000366662 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
TTC13-202ENST00000366662 GGT6Q6P531 493 aa23.06■■□□□ 1.28
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TTC13-202ENST00000366662 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.99■■□□□ 1.27
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TTC13-202ENST00000366662 NLRP13Q86W25 1043 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC13-202ENST00000366662 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC13-202ENST00000366662 ATP7AQ04656 1500 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC13-202ENST00000366662 KANK1Q14678 1352 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC13-202ENST00000366662 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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TTC13-202ENST00000366662 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.94■■□□□ 1.26
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TTC13-202ENST00000366662 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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TTC13-202ENST00000366662 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.82■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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TTC13-202ENST00000366662 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.8■■□□□ 1.24
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