RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.58■■■■□ 3.13
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SERF1A-202ENST00000354833 DIP2BQ9P265 1576 aa34.55■■■■□ 3.12
SERF1A-202ENST00000354833 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.52■■■■□ 3.12
SERF1A-202ENST00000354833 PLA2R1Q13018 1463 aa34.52■■■■□ 3.12
SERF1A-202ENST00000354833 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.51■■■■□ 3.12
SERF1A-202ENST00000354833 ATP10AO60312 1499 aa34.5■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.5■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.49■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 KIF3BO15066 747 aa34.48■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 A2MP01023 1474 aa34.48■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.47■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 MIER1Q8N108 512 aa34.47■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 KANK1Q14678 1352 aa34.46■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
SERF1A-202ENST00000354833 RAPGEF3O95398 923 aa34.43■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.42■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 TET3O43151 1660 aa34.4■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.4■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 RICTORQ6R327 1708 aa34.4■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 E9PCH4 1651 aa34.4■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.39■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
SERF1A-202ENST00000354833 ABCA6Q8N139 1617 aa34.39■■■■□ 3.1
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SERF1A-202ENST00000354833 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.31■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.3■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 TRPM2O94759 1503 aa34.29■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.29■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.28■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SERF1A-202ENST00000354833 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.26■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.26■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.25■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 TSPOAP1O95153 1857 aa34.24■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.24■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.24■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.24■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 RGL3Q3MIN7 710 aa34.21■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.2■■■■□ 3.07
SERF1A-202ENST00000354833 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.19■■■■□ 3.06
SERF1A-202ENST00000354833 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.16■■■■□ 3.06
SERF1A-202ENST00000354833 CEP152O94986 1710 aa34.16■■■■□ 3.06
SERF1A-202ENST00000354833 GGT6Q6P531 493 aa34.16■■■■□ 3.06
SERF1A-202ENST00000354833 CLTCL1P53675 1640 aa34.15■■■■□ 3.06
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SERF1A-202ENST00000354833 USP47Q96K76 1375 aa34.13■■■■□ 3.05
SERF1A-202ENST00000354833 ABCC3O15438 1527 aa34.09■■■■□ 3.05
SERF1A-202ENST00000354833 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.07■■■■□ 3.05
SERF1A-202ENST00000354833 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.07■■■■□ 3.04
SERF1A-202ENST00000354833 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.06■■■■□ 3.04
SERF1A-202ENST00000354833 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.06■■■■□ 3.04
SERF1A-202ENST00000354833 NPATQ14207 1427 aa34.05■■■■□ 3.04
SERF1A-202ENST00000354833 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
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SERF1A-202ENST00000354833 STAC3Q96MF2 364 aa34.01■■■■□ 3.03
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SERF1A-202ENST00000354833 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.99■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.99■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.96■■■■□ 3.03
SERF1A-202ENST00000354833 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.95■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 LAMC1P11047 1609 aa33.94■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.93■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 AGLP35573 1532 aa33.92■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 MADDQ8WXG6 1647 aa33.92■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 ANP32CO43423 234 aa33.91■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.91■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 KIF1BO60333 1816 aa33.91■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 NOS1P29475 1434 aa33.89■■■■□ 3.02
SERF1A-202ENST00000354833 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
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SERF1A-202ENST00000354833 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
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SERF1A-202ENST00000354833 MYOM2P54296 1465 aa33.83■■■■□ 3.01
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SERF1A-202ENST00000354833 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
SERF1A-202ENST00000354833 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.72■■■□□ 2.99
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SERF1A-202ENST00000354833 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.69■■■□□ 2.98
SERF1A-202ENST00000354833 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.69■■■□□ 2.98
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