RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC13BO14795 1591 aa40.32■■■■■ 4.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.32■■■■■ 4.04
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CTDNEP1-201ENST00000318988 REREQ9P2R6 1566 aa40.29■■■■■ 4.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 KANK1Q14678 1352 aa40.28■■■■■ 4.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.27■■■■■ 4.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PZPP20742 1482 aa40.23■■■■■ 4.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 GGT6Q6P531 493 aa40.23■■■■■ 4.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEPDC5O75140 1603 aa40.22■■■■■ 4.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.22■■■■■ 4.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.21■■■■■ 4.03
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.19■■■■■ 4.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.16■■■■■ 4.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PKD2Q13563 968 aa40.14■■■■■ 4.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.11■■■■■ 4.01
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.06■■■■■ 4
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TET3O43151 1660 aa39.97■■■■□ 3.99
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCC3O15438 1527 aa39.95■■■■□ 3.99
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.88■■■■□ 3.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.87■■■■□ 3.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 E9PCH4 1651 aa39.84■■■■□ 3.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NPATQ14207 1427 aa39.76■■■■□ 3.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.72■■■■□ 3.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRTO14522 1441 aa39.71■■■■□ 3.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2R1Q13018 1463 aa39.71■■■■□ 3.95
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TONSLQ96HA7 1378 aa39.67■■■■□ 3.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPM2O94759 1503 aa39.66■■■■□ 3.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMYM3Q14202 1370 aa39.65■■■■□ 3.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.59■■■■□ 3.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MROH2AA6NES4 1674 aa39.57■■■■□ 3.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.53■■■■□ 3.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.48■■■■□ 3.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.45■■■■□ 3.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.45■■■■□ 3.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGL3Q3MIN7 710 aa39.43■■■■□ 3.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.42■■■■□ 3.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TNRQ92752 1358 aa39.38■■■■□ 3.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.31■■■■□ 3.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.3■■■■□ 3.88
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.19■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.08■■■■□ 3.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.08■■■■□ 3.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.04■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.03■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOM2P54296 1465 aa39.03■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.02■■■■□ 3.84
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
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