RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306026.5

USP19-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 2

Gene USP19, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-201ENST00000306026 PKD2Q13563 968 aa28.47■■■□□ 2.15
USP19-201ENST00000306026 FOXD1Q16676 465 aa28.47■■■□□ 2.15
USP19-201ENST00000306026 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.46■■■□□ 2.15
USP19-201ENST00000306026 ABCA6Q8N139 1617 aa28.44■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.44■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.43■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.41■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.4■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.4■■■□□ 2.14
USP19-201ENST00000306026 KANK1Q14678 1352 aa28.39■■■□□ 2.13
USP19-201ENST00000306026 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.37■■■□□ 2.13
USP19-201ENST00000306026 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.37■■■□□ 2.13
USP19-201ENST00000306026 DEPDC5O75140 1603 aa28.35■■■□□ 2.13
USP19-201ENST00000306026 ATP10AO60312 1499 aa28.32■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 TONSLQ96HA7 1378 aa28.31■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 GGT6Q6P531 493 aa28.29■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.27■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.27■■■□□ 2.12
USP19-201ENST00000306026 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.26■■■□□ 2.11
USP19-201ENST00000306026 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
USP19-201ENST00000306026 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.22■■■□□ 2.11
USP19-201ENST00000306026 REREQ9P2R6 1566 aa28.21■■■□□ 2.11
USP19-201ENST00000306026 TET3O43151 1660 aa28.19■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.18■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 AGLP35573 1532 aa28.16■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.14■■■□□ 2.1
USP19-201ENST00000306026 PLA2R1Q13018 1463 aa28.13■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 E9PCH4 1651 aa28.13■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.12■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.11■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 ABCC3O15438 1527 aa28.11■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 CEP152O94986 1710 aa28.09■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.08■■■□□ 2.09
USP19-201ENST00000306026 PTPRTO14522 1441 aa28.07■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 TRPM2O94759 1503 aa28.03■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 NPATQ14207 1427 aa28.02■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 MLECQ14165 292 aa28.02■■■□□ 2.08
USP19-201ENST00000306026 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28■■■□□ 2.07
USP19-201ENST00000306026 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28■■■□□ 2.07
USP19-201ENST00000306026 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28■■■□□ 2.07
USP19-201ENST00000306026 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.98■■■□□ 2.07
USP19-201ENST00000306026 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 RGL3Q3MIN7 710 aa27.94■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.93■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.91■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 CLTCL1P53675 1640 aa27.91■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 NOS1P29475 1434 aa27.89■■■□□ 2.06
USP19-201ENST00000306026 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.88■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.88■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.86■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.85■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
USP19-201ENST00000306026 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.82■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.8■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 ZMYM3Q14202 1370 aa27.79■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.79■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 ERVK-7P63135 1459 aa27.78■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 SYNMO15061 1565 aa27.78■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 STAC3Q96MF2 364 aa27.77■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.77■■■□□ 2.04
USP19-201ENST00000306026 KIF1BO60333 1816 aa27.75■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 IDI1Q13907 227 aa27.74■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.73■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 PIK3C2BO00750 1634 aa27.72■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 ADGRB3O60242 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.7■■■□□ 2.03
USP19-201ENST00000306026 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.69■■■□□ 2.02
USP19-201ENST00000306026 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
USP19-201ENST00000306026 MROH2AA6NES4 1674 aa27.66■■■□□ 2.02
USP19-201ENST00000306026 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.66■■■□□ 2.02
USP19-201ENST00000306026 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.63■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.63■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 MYOM2P54296 1465 aa27.62■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 TNRQ92752 1358 aa27.61■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.61■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 MADDQ8WXG6 1647 aa27.58■■■□□ 2.01
USP19-201ENST00000306026 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.57■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.57■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.56■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.56■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 USP47Q96K76 1375 aa27.55■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
USP19-201ENST00000306026 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms