RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 GLI2P10070 1586 aa30.38■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM5CP41229 1560 aa30.38■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.38■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.37■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.36■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.35■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP10AO60312 1499 aa30.34■■■□□ 2.45
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.31■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.31■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PLA2R1Q13018 1463 aa30.3■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.3■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.29■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.28■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.28■■■□□ 2.44
SNRNP25-201ENST00000293861 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 KANK1Q14678 1352 aa30.25■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.24■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 E9PCH4 1651 aa30.24■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 TET3O43151 1660 aa30.24■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 A2MP01023 1474 aa30.22■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 DIP2BQ9P265 1576 aa30.22■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.21■■■□□ 2.43
SNRNP25-201ENST00000293861 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.2■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF3BO15066 747 aa30.2■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.16■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.16■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 RICTORQ6R327 1708 aa30.15■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPM2O94759 1503 aa30.15■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA6Q8N139 1617 aa30.14■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.14■■■□□ 2.42
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRTO14522 1441 aa30.13■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC7Q96M83 1385 aa30.12■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.11■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.11■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ANP32CO43423 234 aa30.1■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.1■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP152O94986 1710 aa30.1■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.1■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 USP47Q96K76 1375 aa30.09■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 CCER2I3L3R5 266 aa30.08■■■□□ 2.41
SNRNP25-201ENST00000293861 RAPGEF3O95398 923 aa30.07■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.07■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.06■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.06■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.06■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.04■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMC1P11047 1609 aa30.04■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.01■■■□□ 2.4
SNRNP25-201ENST00000293861 NEURL4Q96JN8 1562 aa30■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CLTCL1P53675 1640 aa30■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 RGL3Q3MIN7 710 aa30■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.99■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.98■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.95■■■□□ 2.39
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPOAP1O95153 1857 aa29.95■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 STAC3Q96MF2 364 aa29.93■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.91■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC3O15438 1527 aa29.91■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.9■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF1BO60333 1816 aa29.89■■■□□ 2.38
SNRNP25-201ENST00000293861 MADDQ8WXG6 1647 aa29.88■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 GGT6Q6P531 493 aa29.88■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 NPATQ14207 1427 aa29.84■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.84■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.83■■■□□ 2.37
SNRNP25-201ENST00000293861 REREQ9P2R6 1566 aa29.82■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.82■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.81■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.8■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.79■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 IFT172Q9UG01 1749 aa29.79■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.79■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.77■■■□□ 2.36
SNRNP25-201ENST00000293861 MYOM2P54296 1465 aa29.75■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 IQGAP1P46940 1657 aa29.75■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 ADGRB3O60242 1522 aa29.74■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 MROH2AA6NES4 1674 aa29.74■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 AGLP35573 1532 aa29.73■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 NOS1P29475 1434 aa29.73■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SNRNP25-201ENST00000293861 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.69■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3C2BO00750 1634 aa29.67■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.66■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 SYNMO15061 1565 aa29.64■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.64■■■□□ 2.34
SNRNP25-201ENST00000293861 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.63■■■□□ 2.33
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