RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287020.6

GDF6-201, Transcript of growth differentiation factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDF6, Length 3,701 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6-201ENST00000287020 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
GDF6-201ENST00000287020 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GDF6-201ENST00000287020 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
GDF6-201ENST00000287020 PKD2Q13563 968 aa20.53■□□□□ 0.88
GDF6-201ENST00000287020 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.51■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.5■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.5■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.49■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 CBX1P83916 185 aa20.48■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 AAMPQ13685 434 aa20.48■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 MAP7D2Q96T17 732 aa20.48■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 NCOA1Q15788 1441 aa20.47■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 RNF214Q8ND24 703 aa20.47■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 APAF1O14727 1248 aa20.46■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.45■□□□□ 0.87
GDF6-201ENST00000287020 PANK3Q9H999 370 aa20.45■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 IGSF3O75054 1194 aa20.44■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.43■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 IGHDP01880 384 aa20.42■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.42■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 FGD1P98174 961 aa20.4■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.4■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 ERBB4Q15303 1308 aa20.4■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.39■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.39■□□□□ 0.86
GDF6-201ENST00000287020 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.38■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 MCTP1Q6DN14 999 aa20.38■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 VGLL3A8MV65 326 aa20.38■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 MAP3K1Q13233 1512 aa20.37■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.35■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.34■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 PRXQ9BXM0 1461 aa20.33■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 FAM177BA6PVY3 158 aa20.33■□□□□ 0.85
GDF6-201ENST00000287020 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.33■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.32■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 NAIPQ13075 1403 aa20.32■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 TIAM1Q13009 1591 aa20.3■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 HFM1A2PYH4 1435 aa20.3■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 TMF1P82094 1093 aa20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 TSC1Q92574 1164 aa20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.29■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 OFD1O75665 1012 aa20.28■□□□□ 0.84
GDF6-201ENST00000287020 APBB1O00213 710 aa20.27■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.27■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.27■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 LNPKQ9C0E8 428 aa20.26■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 PTPRKQ15262 1439 aa20.26■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 FSD2A1L4K1 749 aa20.25■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 PTMSP20962 102 aa20.25■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 NCOA2Q15596 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 E9PSI1 815 aa20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 SSFA2P28290 1259 aa20.23■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.22■□□□□ 0.83
GDF6-201ENST00000287020 TSPY4P0CV99 314 aa20.2■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 TSPY10P0CW01 314 aa20.2■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.2■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.19■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.18■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 RIPK4P57078 832 aa20.18■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 IGF1RP08069 1367 aa20.18■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.17■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.16■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.16■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 NCAPD3P42695 1498 aa20.16■□□□□ 0.82
GDF6-201ENST00000287020 NUP155O75694 1391 aa20.16■□□□□ 0.82
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