RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.48■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 COG3Q96JB2 828 aa25.48■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.47■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.47■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.46■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 GPATCH3Q96I76 525 aa25.45■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.45■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.41■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
USP25-202ENST00000285681 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.38■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 NCAPD3P42695 1498 aa25.36■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 USP47Q96K76 1375 aa25.36■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.36■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 EVA1CP58658 441 aa25.34■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
USP25-202ENST00000285681 G3V3G9 751 aa25.32■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.32■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 CLSTN1O94985 981 aa25.31■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 TEFQ10587 303 aa25.31■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 GBP4Q96PP9 640 aa25.29■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USP25-202ENST00000285681 PSME1Q06323 249 aa25.26■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 STAC3Q96MF2 364 aa25.26■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.25■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 DRC7Q8IY82 874 aa25.25■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 E9PSI1 815 aa25.24■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 PTMSP20962 102 aa25.22■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.22■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.21■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 GRIN2BQ13224 1484 aa25.21■■□□□ 1.63
USP25-202ENST00000285681 CUX1P39880 1505 aa25.2■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.19■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 TOMM22Q9NS69 142 aa25.17■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.17■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 APAF1O14727 1248 aa25.17■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.16■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP25-202ENST00000285681 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.14■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 AFAP1Q8N556 730 aa25.14■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 ATF3P18847 181 aa25.13■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 PRDM2Q13029 1718 aa25.12■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 NGEFQ8N5V2 710 aa25.11■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.11■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 RIPK4P57078 832 aa25.1■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 ST18O60284 1047 aa25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 MSH5O43196 834 aa25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 SYNJ2O15056 1496 aa25.08■■□□□ 1.61
USP25-202ENST00000285681 NCOA2Q15596 1464 aa25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 KIF3AQ9Y496 699 aa25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 RILPL2Q969X0 211 aa25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.07■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 PLIN1O60240 522 aa25.06■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.06■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 KIF16BQ96L93 1317 aa25.06■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 KIF21BO75037 1637 aa25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 COG6Q9Y2V7 657 aa25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.05■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.04■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 MIA2Q96PC5 1412 aa25.04■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 RUNDC1Q96C34 613 aa25.03■■□□□ 1.6
USP25-202ENST00000285681 CFTRP13569 1480 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms