RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.87■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 PRXQ9BXM0 1461 aa19.87■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 BCAR3O75815 825 aa19.87■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.86■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.85■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.84■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 GBP4Q96PP9 640 aa19.84■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.83■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 CFTRP13569 1480 aa19.83■□□□□ 0.77
USP43-201ENST00000285199 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.83■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 POGKQ9P215 609 aa19.83■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.8■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 NCOA2Q15596 1464 aa19.78■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 CASC1Q6TDU7 716 aa19.77■□□□□ 0.76
USP43-201ENST00000285199 GGT6Q6P531 493 aa19.76■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.76■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 E9PSI1 815 aa19.75■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.74■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 LNPKQ9C0E8 428 aa19.74■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.74■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.73■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 MAPKBP1O60336 1514 aa19.73■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 NAIPQ13075 1403 aa19.73■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 C14orf37Q86TY3 774 aa19.71■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 HFM1A2PYH4 1435 aa19.71■□□□□ 0.75
USP43-201ENST00000285199 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.7■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.69■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 TRAK2O60296 914 aa19.69■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 KIF3BO15066 747 aa19.68■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.68■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 TIAM1Q13009 1591 aa19.67■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.66■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.66■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.66■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 PPP2R1AP30153 589 aa19.65■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.65■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 MPNDQ8N594 471 aa19.65■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.64■□□□□ 0.74
USP43-201ENST00000285199 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.63■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.63■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.62■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 JPH4Q96JJ6 628 aa19.62■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 KCNJ4P48050 445 aa19.61■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 DRC7Q8IY82 874 aa19.59■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.59■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.59■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 RNF214Q8ND24 703 aa19.59■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 CUX1P39880 1505 aa19.59■□□□□ 0.73
USP43-201ENST00000285199 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 PTPRKQ15262 1439 aa19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.57■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.56■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 MCTP1Q6DN14 999 aa19.56■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 ERCC6Q03468 1493 aa19.55■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.55■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.55■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 NUTM2FA1L443 756 aa19.54■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 NCOA1Q15788 1441 aa19.54■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 MRE11P49959 708 aa19.54■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 MTHFSP49914 203 aa19.53■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 MCM4P33991 863 aa19.52■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.52■□□□□ 0.72
USP43-201ENST00000285199 TOP2BQ02880 1626 aa19.51■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.51■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 FGD1P98174 961 aa19.51■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.51■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 IGHDP01880 384 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 RIPK4P57078 832 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 MLECQ14165 292 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 PANK2Q9BZ23 570 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.5■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.49■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.49■□□□□ 0.71
USP43-201ENST00000285199 RILPL2Q969X0 211 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms