RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 PTPRKQ15262 1439 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 NCOA1Q15788 1441 aa37.14■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 HSPA2P54652 639 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.1■■■■□ 3.53
PPP4C-201ENST00000279387 ADGRL2O95490 1459 aa37.09■■■■□ 3.53
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PPP4C-201ENST00000279387 CEP152O94986 1710 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4C-201ENST00000279387 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
PPP4C-201ENST00000279387 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
PPP4C-201ENST00000279387 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.02■■■■□ 3.52
PPP4C-201ENST00000279387 ABCC3O15438 1527 aa37.01■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.511e-10■■□□□ 12.5
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PPP4C-201ENST00000279387 NPATQ14207 1427 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 DEPDC5O75140 1603 aa36.95■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PPP4C-201ENST00000279387 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.93■■■■□ 3.5
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PPP4C-201ENST00000279387 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.91■■■■□ 3.5
PPP4C-201ENST00000279387 ROCK1Q13464 1354 aa36.89■■■■□ 3.5
PPP4C-201ENST00000279387 KANK1Q14678 1352 aa36.84■■■■□ 3.49
PPP4C-201ENST00000279387 TNRQ92752 1358 aa36.82■■■■□ 3.48
PPP4C-201ENST00000279387 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-201ENST00000279387 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-201ENST00000279387 STRCQ7RTU9 1775 aa36.76■■■■□ 3.48
PPP4C-201ENST00000279387 ERVK-7P63135 1459 aa36.74■■■■□ 3.47
PPP4C-201ENST00000279387 UNC13BO14795 1591 aa36.72■■■■□ 3.47
PPP4C-201ENST00000279387 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.72■■■■□ 3.47
PPP4C-201ENST00000279387 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.69■■■■□ 3.46
PPP4C-201ENST00000279387 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.68■■■■□ 3.46
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.67■■■■□ 3.46
PPP4C-201ENST00000279387 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP4C-201ENST00000279387 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.64■■■■□ 3.46
PPP4C-201ENST00000279387 NAIPQ13075 1403 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP4C-201ENST00000279387 NLRP1Q9C000 1473 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP4C-201ENST00000279387 TET3O43151 1660 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-201ENST00000279387 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.6■■■■□ 3.45
PPP4C-201ENST00000279387 NUP155O75694 1391 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-201ENST00000279387 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP4C-201ENST00000279387 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP4C-201ENST00000279387 HFM1A2PYH4 1435 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP4C-201ENST00000279387 SYNMO15061 1565 aa36.53■■■■□ 3.44
PPP4C-201ENST00000279387 E9PCH4 1651 aa36.51■■■■□ 3.44
PPP4C-201ENST00000279387 PLA2R1Q13018 1463 aa36.51■■■■□ 3.43
PPP4C-201ENST00000279387 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.49■■■■□ 3.43
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PPP4C-201ENST00000279387 NOS1P29475 1434 aa36.47■■■■□ 3.43
PPP4C-201ENST00000279387 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
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PPP4C-201ENST00000279387 PTPRTO14522 1441 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP4C-201ENST00000279387 IDI1Q13907 227 aa36.42■■■■□ 3.42
PPP4C-201ENST00000279387 PKD2Q13563 968 aa36.42■■■■□ 3.42
PPP4C-201ENST00000279387 TRIM52Q96A61 297 aa36.42■■■■□ 3.42
PPP4C-201ENST00000279387 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP4C-201ENST00000279387 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-201ENST00000279387 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.35■■■■□ 3.41
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PPP4C-201ENST00000279387 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4C-201ENST00000279387 ADGRB3O60242 1522 aa36.28■■■■□ 3.4
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PPP4C-201ENST00000279387 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.21■■■■□ 3.39
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PPP4C-201ENST00000279387 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP4C-201ENST00000279387 FOXD1Q16676 465 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP4C-201ENST00000279387 EID1Q9Y6B2 187 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP4C-201ENST00000279387 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.14■■■■□ 3.38
PPP4C-201ENST00000279387 CLTCL1P53675 1640 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP4C-201ENST00000279387 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
PPP4C-201ENST00000279387 TRPM2O94759 1503 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-201ENST00000279387 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-201ENST00000279387 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.08■■■■□ 3.37
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