RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272139.4

C1orf35-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf35, Length 1,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-201ENST00000272139 KIF3BO15066 747 aa34.41■■■■□ 3.1
C1orf35-201ENST00000272139 ERBINQ96RT1 1412 aa34.4■■■■□ 3.1
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.39■■■■□ 3.1
C1orf35-201ENST00000272139 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.35■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 HFM1A2PYH4 1435 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 NAIPQ13075 1403 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 GGT6Q6P531 493 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 C3P01024 1663 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 MROH2AA6NES4 1674 aa34.33■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.33■■■■□ 3.09
C1orf35-201ENST00000272139 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.3■■■■□ 3.08
C1orf35-201ENST00000272139 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.24■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.071e-8■■■□□ 15.2
C1orf35-201ENST00000272139 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.22■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 ZMYM3Q14202 1370 aa34.22■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 HSPA2P54652 639 aa34.21■■■■□ 3.07
C1orf35-201ENST00000272139 DEPDC5O75140 1603 aa34.2■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 NPATQ14207 1427 aa34.19■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.18■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 KANK1Q14678 1352 aa34.17■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.16■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.15■■■■□ 3.06
C1orf35-201ENST00000272139 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 UNC13BO14795 1591 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.1■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.1■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 TRIM52Q96A61 297 aa34.09■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.09■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 NUP155O75694 1391 aa34.08■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 CEP152O94986 1710 aa34.08■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
C1orf35-201ENST00000272139 ABCC3O15438 1527 aa34.04■■■■□ 3.04
C1orf35-201ENST00000272139 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.04■■■■□ 3.04
C1orf35-201ENST00000272139 HRCP23327 699 aa34.03■■■■□ 3.04
C1orf35-201ENST00000272139 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.01■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.98■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.97■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 PZPP20742 1482 aa33.97■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.96■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
C1orf35-201ENST00000272139 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.95■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 TET3O43151 1660 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 STRCQ7RTU9 1775 aa33.92■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
C1orf35-201ENST00000272139 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.87■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.87■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 TNRQ92752 1358 aa33.87■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.85■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.84■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 E9PCH4 1651 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf35-201ENST00000272139 PTPRTO14522 1441 aa33.81■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 PKD2Q13563 968 aa33.8■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 PLA2R1Q13018 1463 aa33.8■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 NLRP1Q9C000 1473 aa33.77■■■■□ 3
C1orf35-201ENST00000272139 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.75■■■□□ 2.99
C1orf35-201ENST00000272139 ERVK-7P63135 1459 aa33.74■■■□□ 2.99
C1orf35-201ENST00000272139 FOXD1Q16676 465 aa33.69■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 NOS1P29475 1434 aa33.67■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.67■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 FBXO41Q8TF61 875 aa33.66■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.66■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf35-201ENST00000272139 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
C1orf35-201ENST00000272139 SYNMO15061 1565 aa33.62■■■□□ 2.97
C1orf35-201ENST00000272139 CERKQ8TCT0 537 aa33.62■■■□□ 2.97
C1orf35-201ENST00000272139 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.6■■■□□ 2.97
C1orf35-201ENST00000272139 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
C1orf35-201ENST00000272139 IDI1Q13907 227 aa33.55■■■□□ 2.96
C1orf35-201ENST00000272139 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
C1orf35-201ENST00000272139 TRPM2O94759 1503 aa33.54■■■□□ 2.96
C1orf35-201ENST00000272139 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.53■■■□□ 2.96
C1orf35-201ENST00000272139 PIK3C2BO00750 1634 aa33.51■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.5■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.49■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 CLTCL1P53675 1640 aa33.47■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.46■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 KIF1BO60333 1816 aa33.45■■■□□ 2.95
C1orf35-201ENST00000272139 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 MED14O60244 1454 aa33.43■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.4■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.4■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
C1orf35-201ENST00000272139 ADGRB3O60242 1522 aa33.38■■■□□ 2.93
C1orf35-201ENST00000272139 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms