RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.42■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.42■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.4■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.39■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 HMMRO75330 724 aa22.37■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 KIF3BO15066 747 aa22.35■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 ST18O60284 1047 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 PHF14O94880 888 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 KIF16BQ96L93 1317 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.32■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 PLIN1O60240 522 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 TPM3P06753 285 aa22.3■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 RILPL2Q969X0 211 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 H3BQV1 296 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 PDE4AP27815 886 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 IFFO2Q5TF58 517 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 NLRP13Q86W25 1043 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 VPS53Q5VIR6 699 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 JPH4Q96JJ6 628 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 GSE1Q14687 1217 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 FAM161AQ3B820 660 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 PDE3BQ13370 1112 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 CRBNQ96SW2 442 aa22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 MARCH6O60337 910 aa22.2■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF592Q92610 1267 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 EID1Q9Y6B2 187 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 CEP89Q96ST8 783 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 NUTM2FA1L443 756 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 AMPHP49418 695 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 G3V3G9 751 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 USP35Q9P2H5 1018 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 KIF15Q9NS87 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 KIF3AQ9Y496 699 aa22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 BECN2A8MW95 431 aa22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 MCTP1Q6DN14 999 aa22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 PANK3Q9H999 370 aa22.14■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PRDM2Q13029 1718 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 COG6Q9Y2V7 657 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.11■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 WWC1Q8IX03 1113 aa22.1■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PTPRGP23470 1445 aa22.1■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.09■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.08■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
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