RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 ROCK1Q13464 1354 aa13.68□□□□□ -0.22
TTPAL-201ENST00000262605 SAMD9Q5K651 1589 aa13.68□□□□□ -0.22
TTPAL-201ENST00000262605 AKNAQ7Z591 1439 aa13.67□□□□□ -0.22
TTPAL-201ENST00000262605 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
TTPAL-201ENST00000262605 PANK3Q9H999 370 aa13.67□□□□□ -0.22
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TTPAL-201ENST00000262605 CD109Q6YHK3 1445 aa13.63□□□□□ -0.23
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TTPAL-201ENST00000262605 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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TTPAL-201ENST00000262605 ASXL2Q76L83 1435 aa13.57□□□□□ -0.24
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TTPAL-201ENST00000262605 CHD1O14646 1710 aa13.55□□□□□ -0.24
TTPAL-201ENST00000262605 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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TTPAL-201ENST00000262605 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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TTPAL-201ENST00000262605 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TTPAL-201ENST00000262605 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TTPAL-201ENST00000262605 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
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TTPAL-201ENST00000262605 ERBINQ96RT1 1412 aa13.52□□□□□ -0.24
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TTPAL-201ENST00000262605 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.51□□□□□ -0.25
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TTPAL-201ENST00000262605 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.48□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TTPAL-201ENST00000262605 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.44□□□□□ -0.26
TTPAL-201ENST00000262605 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TTPAL-201ENST00000262605 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TTPAL-201ENST00000262605 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.43□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 PRAM1Q96QH2 718 aa13.42□□□□□ -0.26
TTPAL-201ENST00000262605 ABCA8O94911 1581 aa13.42□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.41□□□□□ -0.26
TTPAL-201ENST00000262605 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 STAC3Q96MF2 364 aa13.4□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.4□□□□□ -0.26
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TTPAL-201ENST00000262605 RGS3P49796 1198 aa13.39□□□□□ -0.27
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TTPAL-201ENST00000262605 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA2Q08379 1002 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.38□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 PLIN1O60240 522 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 PZPP20742 1482 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.37□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 APAF1O14727 1248 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 COG3Q96JB2 828 aa13.36□□□□□ -0.27
TTPAL-201ENST00000262605 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
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