RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.29■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 COG6Q9Y2V7 657 aa30.29■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.28■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.26■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 MCCP23508 829 aa30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 USP35Q9P2H5 1018 aa30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.23■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 E9PSI1 815 aa30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 CFAP44Q96MT7 982 aa30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.17■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.423e-6■■■□□ 18.2
CHSY1-201ENST00000254190 SYNJ1O43426 1573 aa30.15■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 GSE1Q14687 1217 aa30.15■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC184Q52MB2 194 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.11■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.1■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 NCOA2Q15596 1464 aa30.1■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.08■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.07■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.07■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 NUTM2FA1L443 756 aa30.06■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PTPRGP23470 1445 aa30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 STK31Q9BXU1 1019 aa30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.03■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PRXQ9BXM0 1461 aa30.03■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.02■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.02■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ARID3AQ99856 593 aa30.01■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 PTMSP20962 102 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 DRC7Q8IY82 874 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.99■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 HMMRO75330 724 aa29.98■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CFTRP13569 1480 aa29.98■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CUX1P39880 1505 aa29.96■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 NCAPD3P42695 1498 aa29.95■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 AKNAQ7Z591 1439 aa29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 PANK1Q8TE04 598 aa29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 WDR97A6NE52 1622 aa29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 NRDCO43847 1150 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 EVC2Q86UK5 1308 aa29.9■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NFKBIBQ15653 356 aa29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 ST18O60284 1047 aa29.87■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.86■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NGEFQ8N5V2 710 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 RIPK4P57078 832 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 AMPHP49418 695 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 RUNDC1Q96C34 613 aa29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 MIA2Q96PC5 1412 aa29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 HFM1A2PYH4 1435 aa29.82■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 LNPKQ9C0E8 428 aa29.8■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 RILPL2Q969X0 211 aa29.78■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 PPP2R1AP30153 589 aa29.76■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.76■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.75■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 COG3Q96JB2 828 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 MTHFSP49914 203 aa29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TIAM1Q13009 1591 aa29.72■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
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