RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HOXD11-201ENST00000249504 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD11-201ENST00000249504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD11-201ENST00000249504 HFM1A2PYH4 1435 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD11-201ENST00000249504 NAIPQ13075 1403 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD11-201ENST00000249504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 DEPDC5O75140 1603 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRMP28827 1452 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD11-201ENST00000249504 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.14■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 MROH2AA6NES4 1674 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 KANK1Q14678 1352 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 CEP152O94986 1710 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 UNC13BO14795 1591 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC3O15438 1527 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 C3P01024 1663 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 ZMYM3Q14202 1370 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD11-201ENST00000249504 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 HRCP23327 699 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 NUP155O75694 1391 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD11-201ENST00000249504 PZPP20742 1482 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM52Q96A61 297 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 TET3O43151 1660 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 NPATQ14207 1427 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXD11-201ENST00000249504 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD11-201ENST00000249504 ERVK-7P63135 1459 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXD11-201ENST00000249504 E9PCH4 1651 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 TNRQ92752 1358 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
HOXD11-201ENST00000249504 NOS1P29475 1434 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXD11-201ENST00000249504 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD11-201ENST00000249504 PKD2Q13563 968 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD11-201ENST00000249504 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.7■■■□□ 2.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
HOXD11-201ENST00000249504 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP1Q9C000 1473 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 SYNMO15061 1565 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXD11-201ENST00000249504 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3C2BO00750 1634 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRTO14522 1441 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA2P54652 639 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 FOXD1Q16676 465 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 TRPM2O94759 1503 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXD11-201ENST00000249504 IDI1Q13907 227 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRB3O60242 1522 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2R1Q13018 1463 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 CLTCL1P53675 1640 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD11-201ENST00000249504 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 KIF1BO60333 1816 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXD11-201ENST00000249504 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXD11-201ENST00000249504 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXD11-201ENST00000249504 STRCQ7RTU9 1775 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXD11-201ENST00000249504 SLIT1O75093 1534 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 EID1Q9Y6B2 187 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXD11-201ENST00000249504 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD11-201ENST00000249504 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.32■■■□□ 2.12
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